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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003123`

染色体: Chr04 坐标: 47841985-47843824 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003123`
名称	SmilChr04G003123
描述	anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase 5
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47841985 - 47843824 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023919`
GeneID	`131023919`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023919`
原始查询	`LOC131023919`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase 5
产物	anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase 5
Arabidopsis	`AT3G50740` (UGT72E1) UDP-glucosyl transferase 72E1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824238] identity=47.6; qcov=0.991; evalue=5.55e-154; confidence=high
Rice	`Os01g0620800` - identity=39.7; qcov=0.994; evalue=2.89e-105; confidence=medium
GO	GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00201 (UDPGT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023919

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057809554.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809554.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057809554.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057809554.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809554.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47842191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B59,B86
`Chr4:47842482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B59,B86
`Chr4:47842605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B86
`Chr4:47842605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr4:47842880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:47843187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,C53,D6
`Chr4:47843253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B139,B7,B85,D4
`Chr4:47843316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr4:47843339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809554.1

464 aa

232

464

UDPGT

PF00201 UDPGT 257-393 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809554.1`	Pfam	`PF00201`	UDPGT	Family	257	393	9.5e-20	71.6	UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953571.1
TTCAGTCTTTAAATTATTTCTTTTTTTTTTTCTTATTTTTTATTCGACTCTTACTCATTTCCCCTTTGCACTATAAATTATCCTTCCAAAAATGGTGTGATAATATTATTTTTCATTTATAATGAAAATGAGGATTGAATAAAGGTTAAGTAGAAAATGAAGAAAAAGAAATAAAAGATTTACGGGTGAAATTTTGATTATCCCTTATTTTTTCATGATAAATTTACAACTAAAGAGAAAACTTAATCTTCATTTTGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023919
ATGGATAGCTCTTGGGCCAATCTTCATGTTGCTATACTATCGAGTCCCGGAATGGGCCACCTAATCCCGGTGCTGCTTCTGGGCAACCGCCTCGCCACCCAGCACGGCGTCAGGGTGAGCGTTCTTCTAGTGACGACCGCCGCGTCGCCGCCGGTGTGGGAGCTCCTGAAGCTCCCCCTCCACCCACTAGTTCAAATACTGGAGCTCCCTCCTGTCGATATCTCTCACCTAATCGATTCCTCCGCCAAAGTCGTCACCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809554.1
MDSSWANLHVAILSSPGMGHLIPVLLLGNRLATQHGVRVSVLLVTTAASPPVWELLKLPLHPLVQILELPPVDISHLIDSSAKVVTQLCLMVRESLPSIRAAMDPRPHALFVDHFGTDALHIAAEFNMPNYVYIPSNAWFTALLLHSPLLHQQIPGDYVDQTDPIQIPGCKPVRPEDLVDPMLDRKDQQYQEYLKVCTNIPLCDGVLINSWKDLEPKTIQALAENRIPVHPIGPLTREVEPGNRDSDLVRWLDRQPHESV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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