当前解析结果
SmilChr04G003124| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003124 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003124 |
| 描述 | BES1/BZR1 homolog protein 2 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 47851420 - 47853851 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023920 |
|---|---|
| GeneID | 131023920 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023920 |
| 原始查询 | LOC131023920 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | BES1/BZR1 homolog protein 2 |
| 产物 | BES1/BZR1 homolog protein 2 |
| Arabidopsis | AT1G75080 (BZR1)Brassinosteroid signaling positive regulator (BZR1) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843845] identity=60.1; qcov=1.02; evalue=1.16e-96; confidence=high |
| Rice | Os07g0580500 (BZR1)- identity=59.8; qcov=1; evalue=2.07e-78; confidence=high |
| GO | GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0009742 (brassinosteroid mediated signaling pathway) |
| KEGG | smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF05687 (BES1_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023920 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057809555.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809555.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809555.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809555.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057809555.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:47852277 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B115 |
Chr4:47852313 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,C84,D1 |
Chr4:47852318 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B40,B67,C38,C44 |
Chr4:47852347 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B10,B75,C73,C74 |
Chr4:47852597 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B18 |
Chr4:47853482 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057809555.1PF05687
BES1_N 8-131 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057809555.1 |
Pfam | PF05687 |
BES1_N | Family | 8 | 131 | 9.1e-65 | 218.3 | BES1/BZR1 plant transcription factor, N-terminal |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。