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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003133`

染色体: Chr04 坐标: 47919396-47920450 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003133`
名称	SmilChr04G003133
描述	allene oxide cyclase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47919396 - 47920450 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023928`
GeneID	`131023928`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023928`
原始查询	`LOC131023928`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	allene oxide cyclase, chloroplastic-like
产物	allene oxide cyclase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G25770` (AOC2) allene oxide cyclase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822168] identity=60.8; qcov=0.778; evalue=3.48e-82; confidence=high
Rice	`Os03g0438100` (AOC) - identity=75.1; qcov=0.741; evalue=3.62e-95; confidence=high
GO	GO:0009695 (jasmonic acid biosynthetic process); GO:0046423 (allene-oxide cyclase activity)
KEGG	smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06351 (Allene_ox_cyc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023928

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809566.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057809566.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809566.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809566.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809566.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47920197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809566.1

239 aa

120

239

Allene_ox_cyc

PF06351 Allene_ox_cyc 64-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809566.1`	Pfam	`PF06351`	Allene_ox_cyc	Family	64	237	4e-94	314.0	Allene oxide cyclase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953583.1
TTACTCCCAACAATCAAATACCATTCATTCAACATTTCCTCCGACAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAAAAGGTGAATCAATTAATTAGCCATGGCAGCTTCATCCGCCTCTACTATTTTGAAGGTTGCCGTCTCCTCCCCTTCTCCCGCCAGACTGCCGCCGTCCGCCGCCTCCCAGAAACTCCCATCCAAGCAGAAACACTCCCTCCCTAAACCCCTCGCTCTCTCCACCACTAAATCATTCTCATGCAGAGCACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023928
ATGGCAGCTTCATCCGCCTCTACTATTTTGAAGGTTGCCGTCTCCTCCCCTTCTCCCGCCAGACTGCCGCCGTCCGCCGCCTCCCAGAAACTCCCATCCAAGCAGAAACACTCCCTCCCTAAACCCCTCGCTCTCTCCACCACTAAATCATTCTCATGCAGAGCACAGGCTGCAGCTGATTCAACACCCCGTCCCCAGAAAGTTCAAGAGCTGCACGTCTACGAGATCAACGAGCGTGATCGCGGCAGCCCCGCATACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809566.1
MAASSASTILKVAVSSPSPARLPPSAASQKLPSKQKHSLPKPLALSTTKSFSCRAQAAADSTPRPQKVQELHVYEINERDRGSPAYLRLSQKTVNSLGDLVPFSNKVYTGDLKKRAGITAGICILIKNEAEKKGDRYEAIYSFYLGDYGHIAVQGPYLTYQDTELAVTGGSGVFEGVYGHVKLHQIIFPFKLFYTFHLKGIPDLPPELLAQPVPPALHVEPTPAAKTCEPGATLPNFTN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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