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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003139`

染色体: Chr04 坐标: 47979514-47980698 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003139`
名称	SmilChr04G003139
描述	uncharacterized SmilChr04G003139
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47979514 - 47980698 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023935`
GeneID	`131023935`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023935`
原始查询	`LOC131023935`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837894]; symbol=AT1G13340; hit=AT1G13340; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837894]; symbol=AT1G13340; hit=AT1G13340; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G13340` (AT1G13340) Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837894] identity=46.8; qcov=0.87; evalue=3.2e-42; confidence=medium
Rice	`Os03g0710000` - identity=45.8; qcov=0.876; evalue=6.07e-40; confidence=medium
GO	GO:0015031 (protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF03398 (Ist1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023935

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809580.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809581.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057809580.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809580.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809580.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47979861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:47980092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B2,B28,B68,B94
`Chr4:47980137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr4:47980294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,C12
`Chr4:47980503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809580.1

225 aa

112

225

Ist1

PF03398 Ist1 28-189 aa

XP_057809581.1

177 aa

177

Ist1

PF03398 Ist1 27-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809580.1`	Pfam	`PF03398`	Ist1	Family	28	189	1.2e-48	165.9	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway
`XP_057809581.1`	Pfam	`PF03398`	Ist1	Family	27	160	5.5e-41	141.0	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953597.1
CACCTCAAACTATATAGTATAAGTAAACATATGAAATCAAAGCATGCAAAAAGAGTTGAGCAGAATGGGGAAGAGGTTGAATGCTCTGCTGGGAAGAAGCTCCAACGCTTCGAAGCTAAGGACGGTGGCGAATCTCGCAGTCGCTAGAATTGCCATACTCAGAAATCTACATGGCGTGAGATGCCGCCAAGCAAGATCCGATGTGATTCAGCTGCTGCACCAACCTCATCAACAACGCGCTCTCCTTCGAGTTGAGCAAG...

XM_057953598.1
CCACCTCAAACTATATAGTATAAGTAAACATATGAAATCAAAGCATGCAAAAAGAGTTGAGCAGAATGGGGAAGAGGTTGAATGCTCTGCTGGGAAGAAGCTCCAACGCTTCGAAGCTAAGGACGGTGGCGAATCTCGCAGTCGCTAGAATTGCCATACTCAGAAATCTACATGGCGTGAGATGCCGCCAAGCAAGATCCGATGTGATTCAGCTGCTGCACCAACCTCATCAACAACGCGCTCTCCTTCGAGTTGAGCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023935
ATGCAAAAAGAGTTGAGCAGAATGGGGAAGAGGTTGAATGCTCTGCTGGGAAGAAGCTCCAACGCTTCGAAGCTAAGGACGGTGGCGAATCTCGCAGTCGCTAGAATTGCCATACTCAGAAATCTACATGGCGTGAGATGCCGCCAAGCAAGATCCGATGTGATTCAGCTGCTGCACCAACCTCATCAACAACGCGCTCTCCTTCGAGTTGAGCAAGTGATGAAGGAGGAAAATGCTTTGGATGCACTGGTTATGATAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809580.1
MQKELSRMGKRLNALLGRSSNASKLRTVANLAVARIAILRNLHGVRCRQARSDVIQLLHQPHQQRALLRVEQVMKEENALDALVMIEMCCHILGESTEIITNSRECPDEVKEAVSSLIFAASRSGEFPELQEIRRIFTSKYGKDFAYKAVELRNECRVYPKLVEKLSTERASSESRQIVLKQIAEDNGIALEFIGGSRNMKDDGDAFDSDDAMSGLDIIIENPNV

XP_057809581.1
MQKELSRMGKRLNALLGRSSNASKLRTVANLAVARIAILRNLHGVRCRQARSDVIQLLHQPHQQRALLRVEQVMKEENALDALVMIEMCCHILGESTEIITNSRECPDEVKEAVSSLIFAASRSGEFPELQEIRRIFTSKYGKDFAYKAVELRNECRVYPKRNYRRRERARKADKLC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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