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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003150`

染色体: Chr04 坐标: 48122753-48125214 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003150`
名称	SmilChr04G003150
描述	protein ABA DEFICIENT 4, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	48122753 - 48125214 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023945`
GeneID	`131023945`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023945`
原始查询	`LOC131023945`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ABA DEFICIENT 4, chloroplastic-like
产物	protein ABA DEFICIENT 4%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G67080` (ABA4) abscisic acid (aba)-deficient 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843028] identity=61.7; qcov=0.751; evalue=8.05e-78; confidence=high
Rice	`Os01g0128300` (MHZ4) protein MAO HUZI 4, chloroplastic-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4325995] identity=77.9; qcov=0.536; evalue=3.64e-76; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14108 (ABA4-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023945

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809592.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057809592.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057809592.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057809592.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809592.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:48122888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:48122899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:48122920`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A2
`Chr4:48122920`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A2
`Chr4:48122959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B69
`Chr4:48122976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B131,B69
`Chr4:48122976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B69
`Chr4:48122983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B69
`Chr4:48122990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B69
`Chr4:48123801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:48123900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:48123909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809592.1

261 aa

130

261

ABA4-like

PF14108 ABA4-like 108-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809592.1`	Pfam	`PF14108`	ABA4-like	Family	108	235	7.8e-35	120.8	ABA DEFICIENT 4-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953609.1
ATGAAGCCGACCCCTCCTTTATTTATTATACACATGGAAGCATTCGTGTCTCCAAACCAGACCTTCTCTTTTCCTTTTTCTTGCTCCATCATCTCTCTCTGCTGACCTCAACCTCCTCTTATATTATATGGACCCCTCCTCTCCTGCACAACCCTTTTATTTTTTGTTTGCTTTTCTTGTCTTGAATTCAGACATGGCGTTGTCTTCTGCTTTTTTCACCTCTCAAGTCTGTGTCTCCTTCAAGGTAGAGCGCCCAAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023945
ATGGACCCCTCCTCTCCTGCACAACCCTTTTATTTTTTGTTTGCTTTTCTTGTCTTGAATTCAGACATGGCGTTGTCTTCTGCTTTTTTCACCTCTCAAGTCTGTGTCTCCTTCAAGGTAGAGCGCCCAAGATTGGGCTGTAACACCTCGTGCAACAATATCAGAAGCCAAAGATTTGGTCCTCTTCTTAGAAGCAAGAAGAATGAAGTGTTTGGGCAAGCATGGAGAAGTGGGTGCAGAGGCATCAGTAAATCGAATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809592.1
MDPSSPAQPFYFLFAFLVLNSDMALSSAFFTSQVCVSFKVERPRLGCNTSCNNIRSQRFGPLLRSKKNEVFGQAWRSGCRGISKSNVGTKRSAVYASLVPCSEIASGAFTLGTAAVLPFYTLMVVAPQAEFTKKIVASSLPYVLLGALYAYLLYLSWTPDTIRVMFASKYWLPELPGMAKMFSSEMTLASAWIHLLTVDLFAARQVYGDGLQNNIETRHSVSLCLLFCPVGILVHAITKALTTPTKEKITDEDAISTDFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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