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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003166`

染色体: Chr04 坐标: 48267411-48272282 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003166`
名称	SmilChr04G003166
描述	histidine kinase 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	48267411 - 48272282 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023960`
GeneID	`131023960`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023960`
原始查询	`LOC131023960`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histidine kinase 1-like
产物	histidine kinase 1-like
Arabidopsis	`AT2G17820` (HK1) histidine kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816291] identity=61.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0362300` (HK5) - identity=27.9; qcov=0.483; evalue=1.73e-45; confidence=low
GO	GO:0000155 (phosphorelay sensor kinase activity); GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0016310 (phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00072 (Response_reg); PF00512 (HisKA); PF02518 (HATPase_c)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023960

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057809612.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057809612.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057809612.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057809612.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809612.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:48268611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:48268763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:48268764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:48270602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr4:48270688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr4:48271931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809612.1

1142 aa

571

1142

HisKA

HATPase_c

Response_reg

PF00512 HisKA 459-524 aa PF02518 HATPase_c 632-721 aa PF00072 Response_reg 1010-1133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809612.1`	Pfam	`PF00512`	HisKA	Domain	459	524	1e-19	71.1	His Kinase A (phospho-acceptor) domain
`XP_057809612.1`	Pfam	`PF02518`	HATPase_c	Domain	632	721	5.9e-19	69.3	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
`XP_057809612.1`	Pfam	`PF00072`	Response_reg	Domain	1010	1133	1.4e-20	74.2	Response regulator receiver domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953629.1
TCTCTCTCTCTCACAGTTGAGCAAAGCAAACCATATTCCGCCATAACAATAATAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGAAAAACGAGGGAGATAGGTGAGTAAAAAAACAGCAGCACGAGACAGCATTAATAAAGTGGGTGATTTGATTTTGATTTCAAATATGCTCTTCCAACTTTAGTCTGAATTCTCATTGTGATGTTTGTGTTCCTGGCAAATTGATGAATGAATCTTGATCCGTAATTCGATATATATGATGATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023960
ATGATGATGGCATCTTCGGAGAGCTTCCAGAGAGATGTGGAAGAAGAGGAGTGCCAATACCTGTGCGTTTCGTCGTCGTATTACAGCGTGTTCGTGGTTCGGCTGGCGATCATGATCATGCTGGCAATCTTGATAGGCTTGCTCACTCTCCTCACATGGCACATCACCAGAGTCTACACCACCAAATCCCTCAACACTCTAGCATACGGCCTCCGCCACGAGCTCCTCCAGCGCCCCCTCCTCCGCATGTGGAACATCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809612.1
MMMASSESFQRDVEEEECQYLCVSSSYYSVFVVRLAIMIMLAILIGLLTLLTWHITRVYTTKSLNTLAYGLRHELLQRPLLRMWNILNSTVEVATAQVKLSDSVIRRYNKPAASQADQLDLYQVMKELTWALFASRKALNSITLSYRNGFVQAFHRNHRSNNTYYIYSDLTNYSIATSYSVNLLSSHQGWNDQSIHNNMSAIWYREPLDPSTGEKTAKAAPIPPDELINIAGISQVPDGTASWHIAVSKYSDSPLLSAAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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