当前解析结果
SmilChr01G002170| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002170 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002170 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002170 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 37799636 - 37802183 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131024039 |
|---|---|
| GeneID | 131024039 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024039 |
| 原始查询 | LOC131024039 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024039 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057809630.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057809630.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809630.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809630.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809630.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:37799765 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr1:37799767 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,B126 |
Chr1:37799777 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 40 | A13,A2,A5,B105,B11,B112,B120,B129,B16,B28,B33,B37,B50,B59,B66,B68,B8,B84,B86,B96,B97,C10,C2,C22,C28,C3,C30,C32,C35,C38,C56,C59,C64,C7,C71,C72,C76,C79,C81,C85 |
Chr1:37799796 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A1,B140,B20,B27,C60 |
Chr1:37799817 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B29,C12,C18,C75,C84 |
Chr1:37799826 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B24,B29,B56,B71,B97,C41,C85 |
Chr1:37799837 |
T |
TGC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 24 | A22,A24,B102,B111,B119,B131,B133,B137,B20,B21,B22,B34,B42,B60,B73,B79,B9,C19,C22,C32,C66,C74,D10,D11 |
Chr1:37800623 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr1:37800631 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B91,C57 |
Chr1:37800653 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 12 | B134,B139,B22,B50,B80,C23,C44,C46,C5,C62,C8,D10 |
Chr1:37800655 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 12 | B134,B139,B22,B50,B80,C23,C44,C46,C5,C62,C8,D10 |
Chr1:37800668 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 13 | A8,B106,B130,B18,B47,B63,B79,B94,C52,C62,C65,C7,C70 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。