当前解析结果
SmilChr05G002252| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002252 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002252 |
| 描述 | glycine-rich protein 5-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 24201512 - 24211106 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024162 |
|---|---|
| GeneID | 131024162 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024162 |
| 原始查询 | LOC131024162 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glycine-rich protein 5-like |
| 产物 | glycine-rich protein 5-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024162 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057809647.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057809647.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809647.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809647.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809647.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:24210383 |
CGG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B109,B113,C45 |
Chr5:24210383 |
CGG |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | B109,B113,C45 |
Chr5:24210414 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr5:24210417 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C47,D4 |
Chr5:24210438 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B125,B53,B7,C11 |
Chr5:24210498 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B110,B90,C55,C77,D11 |
Chr5:24210506 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,C77 |
Chr5:24210547 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B27,C47 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。