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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002257`

染色体: Chr05 坐标: 24279641-24283635 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002257`
名称	SmilChr05G002257
描述	protein disulfide isomerase pTAC5, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24279641 - 24283635 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024166`
GeneID	`131024166`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024166`
原始查询	`LOC131024166`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein disulfide isomerase pTAC5, chloroplastic
产物	protein disulfide isomerase pTAC5%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G13670` (PTAC5) plastid transcriptionally active 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827001] identity=53.3; qcov=1.03; evalue=3.63e-132; confidence=high
Rice	`Os04g0514400` - identity=46.5; qcov=1.01; evalue=1.88e-89; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01471 (PG_binding_1); PF08823 (PG_binding_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024166

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809650.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057809650.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809650.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809650.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809650.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24279947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B109,B113,C45,C7
`Chr5:24279974`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C60
`Chr5:24279974`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C60
`Chr5:24281213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C31
`Chr5:24282080`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	6	B11,B126,B13,B14,B82,B9
`Chr5:24282088`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B11,B126,B13,B14,B82,B9
`Chr5:24282109`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B11,B126,B14,B82,B9
`Chr5:24282109`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B11,B126,B14,B82,B9
`Chr5:24282111`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B11,B126,B14,B82,B9
`Chr5:24282111`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B11,B126,B14,B82,B9
`Chr5:24282315`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B31,B82,C46
`Chr5:24282315`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B31,B82,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809650.1

381 aa

190

381

PG_binding_2

PG_binding_1

PF08823 PG_binding_2 173-217 aa PF01471 PG_binding_1 176-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809650.1`	Pfam	`PF08823`	PG_binding_2	Domain	173	217	4.5e-05	24.3	Putative peptidoglycan binding domain
`XP_057809650.1`	Pfam	`PF01471`	PG_binding_1	Domain	176	233	2.9e-12	47.3	Putative peptidoglycan binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953667.1
ATTTTCCAATGAATCGTATTTGACTAAACCAAACGCAGCTGAGTAAAATTAAGCGATTGAAGAAGACGGGATGAGGTAGCTAATATTTGAGCCTTGTTGAAGTTGAGAAATATCAGCAGCATGAACCCTTGTTCAACAATCTCCACAAAATCATAGAAAATGTTGGCTTCCACGCTGCCTCTCACTCCAAACCCTACACTCCTCCTTCTTCACAAACCGCATTTCAATACACTTTACTTCAGACCCTTATCCAAACCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024166
ATGTTGGCTTCCACGCTGCCTCTCACTCCAAACCCTACACTCCTCCTTCTTCACAAACCGCATTTCAATACACTTTACTTCAGACCCTTATCCAAACCCCACGTATGCTTCGCATTTCCGCCATCCAACGGCGAGGAGGCGCGCTGGCTGAGGGAGGAGCAGCGCTGGTTGAGGGAGGAGCAGCGCTGGCTGAGGGAGGAGTCCCGCTGGAACGCCGAGCGCCATGCTCTGCTGCAACAGATAAACAGCCTTAAACTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809650.1
MLASTLPLTPNPTLLLLHKPHFNTLYFRPLSKPHVCFAFPPSNGEEARWLREEQRWLREEQRWLREESRWNAERHALLQQINSLKLRIQDLERLNSLQGSETVGNIAKLLQALKESDVTKNVNRIAESGTSAVPLVVESFETATKEEEIVVKEVISIPEKKENVLSRVTLRIGSEGDEVGAMQEALQKLGFYSGEEDMEFTSFSSGTERAVKTWQATLGLREDGIMTADLLHRLFGSSESGLSKNEERKSTDPQKGANGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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