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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002183`

染色体: Chr01 坐标: 37953853-37959736 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002183`
名称	SmilChr01G002183
描述	DIS3-like exonuclease 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37953853 - 37959736 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024211`
GeneID	`131024211`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024211`
原始查询	`LOC131024211`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DIS3-like exonuclease 2
产物	DIS3-like exonuclease 2
Arabidopsis	`AT1G77680` (AT1G77680) Ribonuclease II/R family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844104] identity=52.2; qcov=0.898; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0754100` - identity=46.6; qcov=0.901; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000175 (3'-5'-RNA exonuclease activity); GO:0000178 (exosome (RNase complex)); GO:0000932 (P-body); GO:0003723 (RNA binding); GO:0034427 (GO:0034427)
KEGG	-
Pfam	PF00773 (RNB); PF17849 (OB_Dis3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024211

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809707.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809707.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057809707.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809707.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809707.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37954544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,A14,B51
`Chr1:37954743`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C61
`Chr1:37954743`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C61
`Chr1:37955424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:37955820`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B108
`Chr1:37955820`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B108
`Chr1:37955898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C47,C51,C62
`Chr1:37955948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr1:37955994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C48,D7
`Chr1:37956042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B40,C85
`Chr1:37956198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,D2
`Chr1:37956453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809707.1

1106 aa

553

1106

OB_Dis3

RNB

PF17849 OB_Dis3 411-490 aa PF00773 RNB 520-872 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809707.1`	Pfam	`PF17849`	OB_Dis3	Domain	411	490	5.5e-14	52.7	Dis3-like cold-shock domain 2 (CSD2)
`XP_057809707.1`	Pfam	`PF00773`	RNB	Domain	520	872	1.2e-99	334.4	RNB domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953724.1
CCAATCATCACCTCTCTCTCTCTCTCACGTCACCCACCTTCATTTCTCTCTCTACAATTTTTACATACAACAAACATATATCTATCCCCTCTACCCTGGCTTTTCAAATCAATACGAGTGAGTATATACGTTACTGATACCTAACCCTCATTATTTTCCTTAACCTTTTTCCAATACAATTCTGCCTTTCGCTAGGGTTCATCCGCTGATTTTTTTATTAAAGCGGAAAATTCCCTCTGCGCAGTTTCTTTCCTAGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024211
ATGGGGAGTTTGATTGTGGAATCAAGTGCGGTTTCTACTCACACCGAAGGAATTTTTGTTGAGAGTGATTTGAAAGATAGCAAGAAGAAGAAGCGTCGAGCGAAAAAGTCGAAGCAAACTACGTCAGTAAGCGAAACTGTCCTGGATGCGTCTAGCTCACAGATTGGTAACGCTTCATCGCAGCATATGATGTCACATGAGCATCATCAACTGCCAAAAGAAAGTAATGTAGGCATCGGATTAATGTCCTCAAAACATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809707.1
MGSLIVESSAVSTHTEGIFVESDLKDSKKKKRRAKKSKQTTSVSETVLDASSSQIGNASSQHMMSHEHHQLPKESNVGIGLMSSKHVEELVTDGNLLNQQSVPQDCEEPLSLSSVPGSASSEEPVGPVLIARPLSLSSVPGPASSEEPVGPVLIARPIDSLARRTYFPPHWSTDAMNRALENGELLRAVFRVNAHNRLEAYCKIDGVQTDILLSSVVAQNRAIDGDTVAIVIDSPSLWPRMKGSNETMNNTESGNNLHDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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