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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000651`

染色体: Chr01 坐标: 14494819-14495241 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000651`
名称	SmilChr01G000651
描述	uncharacterized SmilChr01G000651
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	14494819 - 14495241 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024215`
GeneID	`131024215`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024215`
原始查询	`LOC131024215`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=54.8; qcov=0.521; evalue=4.71e-21; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=45.8; qcov=1.03; evalue=6.77e-30; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024215

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809742.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809742.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809742.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809742.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809742.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:14494843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C22,C5,C53,C80
`Chr1:14494851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C27,C41,C71
`Chr1:14494882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D5,D7
`Chr1:14494906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	61	A11,A14,A16,A18,A21,A22,A24,A5,A8,B102,B104,B107,B11,B124,B129,B140,B15,B19,B22,B25,B27,B29,B37,B38,B39,B58,B68,B7,B71,B8,B80,B81,B83,B88,B94,C11,C13,C15,C25,C27,C3,C31,C35,C41,C42,C45,C48,C5,C53,C56,C59,C60,C61,C69,C71,C77,C79,D10,D5,D7,D9
`Chr1:14494934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B126,B88,C53,D5,D7
`Chr1:14494934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B88,C53,D5,D7
`Chr1:14494953`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	29	A14,A2,A25,A3,B104,B109,B111,B16,B20,B27,B50,B63,B64,B81,B98,C10,C13,C21,C27,C29,C32,C33,C36,C46,C5,C54,C56,C72,C86
`Chr1:14494955`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A14,A2,A25,A3,B109,B111,B16,B20,B27,B50,B63,B64,B81,B98,C10,C13,C21,C27,C29,C33,C36,C46,C5,C54,C55,C72,C86
`Chr1:14494997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B129,B66,D10
`Chr1:14494998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B47,C58
`Chr1:14495026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	32	A11,A2,A6,B1,B10,B101,B108,B123,B127,B134,B136,B137,B139,B21,B28,B66,B7,B79,B91,B99,C10,C21,C4,C43,C49,C57,C65,C66,C73,C8,C82,C86
`Chr1:14495063`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809742.1

140 aa

140

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 2-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809742.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	2	75	7.7e-27	95.0	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953759.1
ATGTTCGTGAAGAGTCCGACACATCCTATAGACGAGAAGAGCAAGAGATTCAAGGTGATGCAGGAAGCTGCTCGCAAGGATATTGAACGAGCATTCGGTGTTCTTCAAGCTCGGTGGGCTATCATCAAAGGACCAGCGTGTCTTTGGAGCAAGGCGGAGTTCAGCGACATCATGTTCACGTGCATAATTTTGCACAATATGATCGTCCAAGACGAAGGTGACCATGCTATAAAATGGGCAGACGAGAGCAATGATGAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024215
ATGTTCGTGAAGAGTCCGACACATCCTATAGACGAGAAGAGCAAGAGATTCAAGGTGATGCAGGAAGCTGCTCGCAAGGATATTGAACGAGCATTCGGTGTTCTTCAAGCTCGGTGGGCTATCATCAAAGGACCAGCGTGTCTTTGGAGCAAGGCGGAGTTCAGCGACATCATGTTCACGTGCATAATTTTGCACAATATGATCGTCCAAGACGAAGGTGACCATGCTATAAAATGGGCAGACGAGAGCAATGATGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809742.1
MFVKSPTHPIDEKSKRFKVMQEAARKDIERAFGVLQARWAIIKGPACLWSKAEFSDIMFTCIILHNMIVQDEGDHAIKWADESNDEASSSSAAARPLRGAPPEFRQYVAREASIRDAEMHARLTLDLKEHIWSRFGPVDH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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