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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002310`

染色体: Chr05 坐标: 24936549-24938870 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002310`
名称	SmilChr05G002310
描述	DELLA protein RGL1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24936549 - 24938870 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024216`
GeneID	`131024216`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024216`
原始查询	`LOC131024216`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DELLA protein RGL1-like
产物	DELLA protein RGL1-like
Arabidopsis	`AT1G66350` (RGL1) RGA-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842953] identity=29.2; qcov=0.737; evalue=1.67e-46; confidence=low
Rice	`Os03g0707600` (SLR1) - identity=27.7; qcov=0.779; evalue=1.03e-38; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024216

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809708.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809708.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809708.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809708.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809708.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24937228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:24937310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr5:24937559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B133,C15
`Chr5:24937652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B125,C12,C54
`Chr5:24937817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B125,C12,C54
`Chr5:24937954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:24938024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C12,C54
`Chr5:24938042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C54
`Chr5:24938137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr5:24938194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:24938336`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr5:24938336`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809708.1

506 aa

253

506

GRAS

PF03514 GRAS 138-502 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809708.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	138	502	4.3e-75	253.7	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953725.1
TCAGAAAGAATGTCTGACAGTCAATCCTGTAGCTTTTGCACTCATCTTAAATTTATTTGTTTCCCATTTGTGCATATTCTGTTGTCTTCTTATCCAGAATACATTGATTTGGTCATATAATTTTGCATCGCCTTCATTCCTAGGTAACATCATCAGATGTTTTAACTGAGGCTGAGGTGTTCACTTCCTTTATATTCGTAAAAAACAAAAAACAGCTACTGCTAACGCGGACACATCATTGTCTATGATTTAAAATAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024216
ATGTCTAGCTCTAGCAAGGCCTCTGCAAAGGGAGCTGAGAGAGAAAATCAGAAACAGGGAGACGACGCTCTTGATGAAGGAGTACTTGTTCAGGCTAATGTTGGCCCTCTAGATCATTTATATCTAGAGATGGTTTCTCCACCATTTCAAAATTGTCAAGATAATATGAGAATACTCTCCAAGATCAAACCACAACTTATGCTTCCTTCTGTATCTCCGGAGGTTCTGAGGTGCTGCAGAAGGAGCGTTGGCACAGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809708.1
MSSSSKASAKGAERENQKQGDDALDEGVLVQANVGPLDHLYLEMVSPPFQNCQDNMRILSKIKPQLMLPSVSPEVLRCCRRSVGTENETERTPQSSPKLSANHIIELAAADFIHSNFRLTYASNISGLSADDAKDILLVQNLLKCAEKVCNEQYDCAGKLLEEYSELRINRMKVIQRLVYYFNQALCERIERETGSFRRVLQSSPHDSITKISDIAAVYQKLPLNQVIQFTGIHSVADHVSRCRKVNIVDLNISCGLQMM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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