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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002185`

染色体: Chr01 坐标: 37965979-37970111 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002185`
名称	SmilChr01G002185
描述	uncharacterized SmilChr01G002185
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37965979 - 37970111 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024221`
GeneID	`131024221`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024221`
原始查询	`LOC131024221`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein S18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837232]; symbol=AT1G07210; hit=AT1G07210; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Ribosomal protein S18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837232]; symbol=AT1G07210; hit=AT1G07210; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G07210` (AT1G07210) Ribosomal protein S18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837232] identity=42.3; qcov=1.05; evalue=1.24e-46; confidence=medium
Rice	`Os10g0500500` - identity=60.3; qcov=0.553; evalue=1.38e-45; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005763 (mitochondrial small ribosomal subunit); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0070181 (small ribosomal subunit rRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01084 (Ribosomal_S18)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024221

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057809716.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809716.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809716.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809716.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809716.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37966538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B38,B39,C23
`Chr1:37967914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A19,B109,C14,C74
`Chr1:37969038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B33,B59,B69,C49
`Chr1:37969100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B84,C76
`Chr1:37969736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B17,B62,C30,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809716.1

255 aa

128

255

Ribosomal_S18

PF01084 Ribosomal_S18 167-215 aa

XP_057809723.1

255 aa

128

255

Ribosomal_S18

PF01084 Ribosomal_S18 167-215 aa

XP_057809730.1

255 aa

128

255

Ribosomal_S18

PF01084 Ribosomal_S18 167-215 aa

XP_057809738.1

255 aa

128

255

Ribosomal_S18

PF01084 Ribosomal_S18 167-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809716.1`	Pfam	`PF01084`	Ribosomal_S18	Family	167	215	3.6e-16	59.7	Ribosomal protein S18
`XP_057809723.1`	Pfam	`PF01084`	Ribosomal_S18	Family	167	215	3.6e-16	59.7	Ribosomal protein S18
`XP_057809730.1`	Pfam	`PF01084`	Ribosomal_S18	Family	167	215	3.6e-16	59.7	Ribosomal protein S18
`XP_057809738.1`	Pfam	`PF01084`	Ribosomal_S18	Family	167	215	3.6e-16	59.7	Ribosomal protein S18

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953755.1
GGACCAACCCTAAAGCGAAAATATTATGAATGGGTCATTTGTGGCCCGTATCCATCCGGATCACGATGACCAACGGGTCGGTTCTAAATCCATTTTCGCAGTTTCAGCTGCTGTTGAGAGCTGAAGAGCTAATCTTTAATTCTTTCTCACTCAATCCTTAAACCCTAATAATTTCCCCTCTTCTTCGTCCATCAATTTCAGGGAAAATGAAACTCGTCCGAAGCGCCCTGTGGTCTGCCAACGCCGTTTTGTCTCATCAG...

XM_057953733.1
GGTCATTTGTGGCCCGTATCCATCCGGATCACGATGACCAACGGGTCGGTTCTAAATCCATTTTCGCAGTTTCAGCTGCTGTTGAGAGCTGAAGAGCTAATCTTTAATTCTTTCTCACTCAATCCTTAAACCCTAATAATTTCCCCTCTTCTTCGTCCATCAATTTCAGTGCAGGGAAAATGAAACTCGTCCGAAGCGCCCTGTGGTCTGCCAACGCCGTTTTGTCTCATCAGTTTCAGAGCCCTCGTGTTGTTCGAGCA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131024221
ATGAAACTCGTCCGAAGCGCCCTGTGGTCTGCCAACGCCGTTTTGTCTCATCAGTTTCAGAGCCCTCGTGTTGTTCGAGCATTTTCAGCTAGCGCGTCTCCTGTTAGTGATGATTGGGACAGAGTCAACTCGTCTGATTTCTTTGGGGATTCTCAGCAAGGCAATTCTGGCGATGTGAATTCCTCTAGAATGACTTCCTTTTACGGCAAGCTTGGAAAGCTTGAGAAGGCGGCACATGATGCATATGGGATGGGAGGAGT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057809716.1
MKLVRSALWSANAVLSHQFQSPRVVRAFSASASPVSDDWDRVNSSDFFGDSQQGNSGDVNSSRMTSFYGKLGKLEKAAHDAYGMGGVFGDNMNSLADGMDYKLKKAATYFEFDPFEVTRDDYTFRPDVNFQSGMSYETKDLDLRKPGVRKPSKRMEFVTTTKEVLREADFRNVKFLAKFITEAGIIDKRSKTGISAKAQRKVAREIKTARAFGLMPFTTMGTKQFKYGDTMEAMDRDFEFEPSYDHTFVEEGADA

XP_057809723.1
MKLVRSALWSANAVLSHQFQSPRVVRAFSASASPVSDDWDRVNSSDFFGDSQQGNSGDVNSSRMTSFYGKLGKLEKAAHDAYGMGGVFGDNMNSLADGMDYKLKKAATYFEFDPFEVTRDDYTFRPDVNFQSGMSYETKDLDLRKPGVRKPSKRMEFVTTTKEVLREADFRNVKFLAKFITEAGIIDKRSKTGISAKAQRKVAREIKTARAFGLMPFTTMGTKQFKYGDTMEAMDRDFEFEPSYDHTFVEEGADA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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