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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002323`

染色体: Chr05 坐标: 25035223-25036614 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002323`
名称	SmilChr05G002323
描述	F-box protein CPR1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	25035223 - 25036614 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024225`
GeneID	`131024225`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024225`
原始查询	`LOC131024225`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein CPR1-like
产物	F-box protein CPR1-like
Arabidopsis	`AT4G12560` (CPR1) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869] identity=24.2; qcov=0.851; evalue=1.52e-08; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024225

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809718.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057809718.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809718.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809718.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809718.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:25035639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr5:25035699`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A5,B10,B100,B106,B109,B114,B28,B30,B54,B62,B63,B74,B93,B95,C17,C47,C5,C66,C71
`Chr5:25035705`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A5,B10,B100,B106,B109,B114,B28,B30,B32,B54,B62,B63,B74,B93,B95,C17,C35,C47,C5,C66,C71
`Chr5:25035808`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	55	A13,A21,A25,A5,A9,B10,B100,B101,B103,B106,B109,B111,B112,B114,B117,B119,B12,B120,B128,B129,B2,B24,B28,B30,B31,B32,B37,B54,B59,B63,B68,B69,B7,B74,B80,B93,B94,B95,C14,C17,C22,C24,C30,C32,C33,C35,C47,C5,C50,C66,C7,C71,C77,C81,C82
`Chr5:25035811`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A13,B103,B111,B114,B117,B12,B120,B128,B129,B2,B24,B30,B32,B59,B63,B68,B74,B93,B94,C14,C17,C24,C30,C33,C35,C37,C5,C50,C66,C7,C71,C81
`Chr5:25035814`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	33	A13,A7,B103,B111,B114,B117,B12,B120,B128,B129,B2,B24,B30,B32,B59,B63,B68,B74,B93,B94,C14,C17,C24,C30,C33,C35,C37,C5,C50,C66,C7,C71,C81
`Chr5:25035821`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	34	A13,A7,B103,B111,B114,B117,B12,B120,B128,B129,B2,B29,B30,B32,B59,B63,B68,B74,B88,B93,B94,C14,C17,C24,C30,C33,C35,C37,C5,C50,C66,C7,C71,C81
`Chr5:25035865`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A13,B101,B103,B112,B114,B28,B44,B68,B74,B95,C17,C24,C30,C32,C41,C65,C81
`Chr5:25035941`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A13,A25,A5,A9,B100,B101,B109,B28,B29,B44,B54,B68,B74,C17,C24,C30,C32,C41,C77
`Chr5:25035942`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A13,A25,A5,A9,B100,B101,B109,B28,B29,B44,B54,B68,B74,C17,C24,C30,C32,C41,C77
`Chr5:25036293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,A2,B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809718.1

228 aa

114

228

FBA_1

PF07734 FBA_1 40-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809718.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	40	181	2.1e-09	37.6	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953735.1
TACACACTGAACGTGGACTTAGCAAAGTCTTCTTCAATCAATCCATAAAATGGTTGATCCTACCACTCGGTATTCCTCTCCTCACTACTCAATTTTCTAAAATCAGATCCTACGCAAAATAAATCTCTTCAGCCATGGAGGATCCTACCATTGCAATTCCCAAGCTCCCAAACGACGTCATAATCGAAATTCTCACGAGGCTACCACTAAAACCACTCTTGAAATTCAAGTGCGTCTGCAGATCATGGCGAGCCCTAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024225
ATGGCGAGCCCTAATTTCCAGCCAACAATTCGTCGCAACCCATCTCGAAAACTCAAAATTAGACCTAAATTTCACCACCCACAGACTCATTCTCAACTGTCGAGGGATTTGCCTGAGGTGATCGTGAAAGTTTATAGTTTGAGGAATGATGAGTGGAAGAGGATCAAGAATTTTGAGGGGCGTTGGTTGATGGATGCTCCGGGGGCGTTTACGAATGGAAAGCTGTATTGGATTGCAAGCCAAGGTTACGAGTTAGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809718.1
MASPNFQPTIRRNPSRKLKIRPKFHHPQTHSQLSRDLPEVIVKVYSLRNDEWKRIKNFEGRWLMDAPGAFTNGKLYWIASQGYELDSGLDIVFLDLEKDEYEILQMPSYVKSGYYSRLGVCEPEGSLYVLCSHLTGADVWIMGGQDWTKLLTIPYIDDFLKYTYKRASYVLKDGRVLLLCGSTFVIFDARDSSFRYPKVRDAAEFIAVGAYVETLVSPSYSIKAASLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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