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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002326`

染色体: Chr05 坐标: 25084366-25088821 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002326`
名称	SmilChr05G002326
描述	protein high chlorophyll fluorescent 107-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	25084366 - 25088821 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024229`
GeneID	`131024229`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024229`
原始查询	`LOC131024229`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein high chlorophyll fluorescent 107-like
产物	protein high chlorophyll fluorescent 107-like
Arabidopsis	`AT3G17040` (HCF107) high chlorophyll fluorescent 107 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820961] identity=64.2; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0308800` - identity=63.3; qcov=0.841; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003727 (single-stranded RNA binding); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0006397 (mRNA processing); GO:0006417 (regulation of translation); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF13181 (TPR_8); PF13432 (TPR_16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024229

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809724.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057809724.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809724.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809724.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809724.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:25084582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:25084630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C20,C52,C59
`Chr5:25085330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B74,B77
`Chr5:25086342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B65
`Chr5:25086399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B77,D11
`Chr5:25087591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr5:25088107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B98
`Chr5:25088272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C29
`Chr5:25088481`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C79,D10
`Chr5:25088481`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C79,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809724.1

648 aa

324

648

TPR_16

TPR_8

PF13432 TPR_16 302-363 aa PF13432 TPR_16 334-386 aa PF13181 TPR_8 439-463 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809724.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	302	363	3.6e-15	56.8	Tetratricopeptide repeat
`XP_057809724.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	334	386	3.6e-15	56.8	Tetratricopeptide repeat
`XP_057809724.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	439	463	1.7e-13	50.2	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953741.1
GACGTGGCCAATTCCTAACCAATGGCTTCTTTCCTGTGAAATTCCCATAAGCCCCATTCTTCACAACTCTCAACTCTCTCTCTCTCTCAGGAATGAGCATGTTAACCAGCTGAGTATGCTCTTTGATCATCTTCTACATTCAGCAAAAAACTTCCTCATTTTTCTGTGGGTTCATATCTCTGTCACTGAAATTTTTCTCTACTAAAATATAAGGGAATTTAGGCCACTCAGTAAAATTTCCTCCGCCCAAACACATTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024229
ATGAGTATCTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCATCAAGCTCAAAATTCACTCTCTTTTCACCTTCCCAAAACCCGAACTACTCAAAATTCCATCTCATCACACCCTTAAAAACTCCCAATTCTTCCCCACCACACCGTACACTGCTCCACATACATTCTCATGACTCATCATCTCCGCCAGCTCTTCGAGAAAACCCTCAAACCTCTGCATCGAAAGCTGAAATGGAGGAATATGGAGATGGATTCGATGAGGAGATCATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809724.1
MSIFSSSSSSSSSKFTLFSPSQNPNYSKFHLITPLKTPNSSPPHRTLLHIHSHDSSSPPALRENPQTSASKAEMEEYGDGFDEEIIKAKKSLEELLVVRRPVMEEGRAEEDGGSGVKLQEGAASSKVDEGLSRFAKKMPIFEPKILESGSEEKLLLVNLDLALYKAKLLVRNYRFQEAEEILRKCINYWPEDGRPYVALGKSLSKQSKMNEARAVYEKGCQATQGENSYIWQCWAVLESRMGNIRRARELFDASTVADKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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