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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002328`

染色体: Chr05 坐标: 25134216-25139725 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002328`
名称	SmilChr05G002328
描述	aldehyde dehydrogenase 22A1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	25134216 - 25139725 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024231`
GeneID	`131024231`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024231`
原始查询	`LOC131024231`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aldehyde dehydrogenase 22A1-like
产物	aldehyde dehydrogenase 22A1-like
Arabidopsis	`AT3G66658` (ALDH22A1) aldehyde dehydrogenase 22A1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819849] identity=82.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0688800` (OsALDH22) - identity=83; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004029 (aldehyde dehydrogenase (NAD+) activity)
KEGG	-
Pfam	PF00171 (Aldedh)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024231

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057809726.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057809726.1`
3	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057809726.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809726.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809726.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:25134474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C85
`Chr5:25136359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B122,B82,C60
`Chr5:25136366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C78
`Chr5:25137511`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A2,B122,B82,C60
`Chr5:25137511`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A2,B122,B82,C60
`Chr5:25137512`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	B109,B123,B125,B126,B128,B132,B136,B140,B22,B34,B42,B43,B45,B52,B56,B8,B83,B85,B9,B90,B92,B96,C27,C41,C56,C70,C72,C8,C82,C83
`Chr5:25137517`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A2,A25,B10,B120,B121,B122,B125,B126,B129,B130,B132,B16,B43,B50,B72,B79,B82,B91,C22,C29,C45,C56,C60,C7,C72,C73,C75,C80,D5
`Chr5:25137543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B134,C79,C85,D10
`Chr5:25138810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B77
`Chr5:25139420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr5:25139533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809726.1

591 aa

296

591

Aldedh

PF00171 Aldedh 58-523 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809726.1`	Pfam	`PF00171`	Aldedh	Family	58	523	6.1e-123	411.5	Aldehyde dehydrogenase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953743.1
ACCTGAAGAGTGAGCACTAAACACACTGAGCTCAAGCAATTGTTTCCCTTTCTTAGCTTCTGTTCGATAAATGCGCTCCATTTGAATCGGATTCCAGTTGCATCGTGGAATTCGCATATCGCCTTTTTATCTAGGTTTAATCCGACGCTTTCTTTGAATCCGAATCGATCGGCGAGCTGAAACGATGGCGTTTTGGTGGCCGCTGGTGGTTATCGCCTTTGCCTTCGCGATCTGCAAGTTCCTGCTCATGCTCATTCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024231
ATGGCGTTTTGGTGGCCGCTGGTGGTTATCGCCTTTGCCTTCGCGATCTGCAAGTTCCTGCTCATGCTCATTCCGCCAAATGTGCCTTCGATCGACGTCGACGCCTCCGATGTGCTGGACGATGGGAGTCAGACCAAGGAAAACAGCTTCATCTATATTCCCTCAAGAAGACAGACAGATAAAGTCCAATGCTATGAGCCTGCAACAATGAAATATCTTGGCTATTATCCTGCATTGAAGACTGATGAGGTGAAGGAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809726.1
MAFWWPLVVIAFAFAICKFLLMLIPPNVPSIDVDASDVLDDGSQTKENSFIYIPSRRQTDKVQCYEPATMKYLGYYPALKTDEVKERVAQARKAQKAWAKSSFKKRRQFLRILLKYIIDHQALICEVSSRDTGKTMIDASLGEIMTTCEKITWLLAEGEKWLKPEYRSCGRSMLHKTAKVEFHPLGVIGAIVSWNYPFHNIFNPMLAAVFSGNSIVIKVSEHASWSGCFYLRIIQAALAAVGAPENLVEVITGFAETGEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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