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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002341`

染色体: Chr05 坐标: 25360464-25362626 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002341`
名称	SmilChr05G002341
描述	probable pectinesterase 67
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	25360464 - 25362626 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024242`
GeneID	`131024242`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024242`
原始查询	`LOC131024242`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectinesterase 67
产物	probable pectinesterase 67
Arabidopsis	`AT3G17060` (AT3G17060) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820963] identity=55; qcov=0.912; evalue=6.17e-132; confidence=high
Rice	`Os03g0309400` (OsPME11) - identity=49.5; qcov=0.923; evalue=4.47e-114; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification)
KEGG	-
Pfam	PF01095 (Pectinesterase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024242

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057809746.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057809746.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057809746.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809746.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809746.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:25360958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:25360974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:25361245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C18,C29,C72,D2
`Chr5:25361347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B139
`Chr5:25362331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:25362364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:25362414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B104,C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809746.1

339 aa

170

339

Pectinesterase

PF01095 Pectinesterase 45-331 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809746.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	45	331	4.7e-60	203.6	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953763.1
TTCATGAAACAAGAATTAAATTTAATAAAAGCTACGCTCAGAAATAGATGGATAACTTTTAGTAAATCACTCTTTTTTTTTTCCTCATAATAATCCCATCTTTTCTTCATAAAATTGATAGTTCTTTTGCAGTCATTTTAGATAAATCCAGTTTAACATTGTACAATACCAGAAATGTGAAAAAAGGGGAGAAAAAAAGATTGAAAATCATGCATTTACCTCGCCTCTCTATATTTATTATTGTCACATTATTCATTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024242
ATGCATTTACCTCGCCTCTCTATATTTATTATTGTCACATTATTCATTTTCTTGGATTTTGTACATGGCTTCTCCAACAATAAGGCGATTGATTCTGAAATCTTGACCGAAAACATTCGATCAAATCGAACAATAACCGTTGATGCAACTGGAAAAGGGGATTTCAAATCTGTGCAGGCTGCCGTTGATCATGTCCCAAGTAGGAATTCTAAATGGATTATGATTCATATTTCCAAGGGAGAATATAGGGAAAAGGTAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809746.1
MHLPRLSIFIIVTLFIFLDFVHGFSNNKAIDSEILTENIRSNRTITVDATGKGDFKSVQAAVDHVPSRNSKWIMIHISKGEYREKVKVPHNKPYIFMRGEGRGKTSIVWSRSSADDYESATFKVEAKNFIAFGITFKNAAPTGISHTKQNKAVATVVGADKAAFYHCSFISNHNTLFDSRGRHYYGGCYVQGSVDLIFGHGQSMFYGCDVFVVPNLKSEIKGSIAASHRQRGNASSGFVFVNSKVYGVGDVYLGRAKGTH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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