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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002186`

染色体: Chr01 坐标: 37987439-37988201 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002186`
名称	SmilChr01G002186
描述	peamaclein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37987439 - 37988201 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024243`
GeneID	`131024243`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024243`
原始查询	`LOC131024243`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peamaclein
产物	peamaclein
Arabidopsis	`AT2G39540` (AT2G39540) Gibberellin-regulated family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818539] identity=63.6; qcov=1; evalue=3.95e-36; confidence=medium
Rice	`Os03g0760800` (GASR1) - identity=70.6; qcov=0.773; evalue=3.9e-28; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02704 (GASA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024243

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057809749.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809749.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809749.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809749.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809749.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37987612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr1:37987706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr1:37987737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B13
`Chr1:37987738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr1:37987751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr1:37987779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B124
`Chr1:37987787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C8
`Chr1:37988072`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	93	A10,A11,A15,A18,A2,A20,A22,A25,A5,A6,A7,B104,B109,B114,B119,B122,B13,B131,B133,B135,B136,B137,B138,B140,B17,B18,B2,B22,B27,B29,B32,B34,B35,B4,B41,B44,B45,B5,B50,B51,B53,B54,B58,B60,B61,B63,B65,B67,B68,B69,B73,B76,B77,B79,B80,B86,B91,B94,B95,C12,C13,C14,C2,C21,C22,C24,C25,C27,C29,C33,C36,C38,C39,C4,C40,C42,C45,C63,C64,C66,C7,C70,C71,C76,C78,C79,C82,D1,D11,D2,D3,D4,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809749.1

103 aa

103

GASA

PF02704 GASA 45-103 aa

XP_057809755.1

88 aa

GASA

PF02704 GASA 30-88 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809749.1`	Pfam	`PF02704`	GASA	Family	45	103	3.2e-24	85.5	Gibberellin regulated protein
`XP_057809755.1`	Pfam	`PF02704`	GASA	Family	30	88	2.1e-24	86.1	Gibberellin regulated protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953772.1
CTCACTATTGAATTTCATATCTCATCATTTGTTCTCTCTCGCTCTACACATTTTTTTTTCAAGGCAATTCAATCAAATTTAGGGCAAACATGAAGCCTATGATTCTTGGATTGGTGACCCTTCTCCTAATTCTGACGACCGCATTCGCAGTTGAGGATGTCGGTGGGTCGAGCTTCTGCGACTCGAAGTGCAATGTACGGTGCTCGAAGGCCGGGCGACGCGACCGTTGCCTCAAGTACTGCGGGATATGTTGTGAGAAG...

XM_057953766.1
TTTGTTCTCTCTCGCTCTACACATTTTTTTTTCAAGGTTTTCTTATTCTCGTTATCATAATTAACTAATTAGGAGCTTATATACATGCATGTTCTTTTTCTCGGCAATTCAATCAAATTTAGGGCAAACATGAAGCCTATGATTCTTGGATTGGTGACCCTTCTCCTAATTCTGACGACCGCATTCGCAGTTGAGGATGTCGGTGGGTCGAGCTTCTGCGACTCGAAGTGCAATGTACGGTGCTCGAAGGCCGGGCGACG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024243
ATGCATGTTCTTTTTCTCGGCAATTCAATCAAATTTAGGGCAAACATGAAGCCTATGATTCTTGGATTGGTGACCCTTCTCCTAATTCTGACGACCGCATTCGCAGTTGAGGATGTCGGTGGGTCGAGCTTCTGCGACTCGAAGTGCAATGTACGGTGCTCGAAGGCCGGGCGACGCGACCGTTGCCTCAAGTACTGCGGGATATGTTGTGAGAAGTGCAATTGTGTGCCGTCGGGAACTTATGGGAACAAAGACGAGTG...

LOC131024243
ATGAAGCCTATGATTCTTGGATTGGTGACCCTTCTCCTAATTCTGACGACCGCATTCGCAGTTGAGGATGTCGGTGGGTCGAGCTTCTGCGACTCGAAGTGCAATGTACGGTGCTCGAAGGCCGGGCGACGCGACCGTTGCCTCAAGTACTGCGGGATATGTTGTGAGAAGTGCAATTGTGTGCCGTCGGGAACTTATGGGAACAAAGACGAGTGCCCTTGTTATAGGGACATGAAAAACTCTAAGGGCAACCCTAAGTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809749.1
MHVLFLGNSIKFRANMKPMILGLVTLLLILTTAFAVEDVGGSSFCDSKCNVRCSKAGRRDRCLKYCGICCEKCNCVPSGTYGNKDECPCYRDMKNSKGNPKCP

XP_057809755.1
MKPMILGLVTLLLILTTAFAVEDVGGSSFCDSKCNVRCSKAGRRDRCLKYCGICCEKCNCVPSGTYGNKDECPCYRDMKNSKGNPKCP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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