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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002346`

染色体: Chr05 坐标: 25437504-25441311 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002346`
名称	SmilChr05G002346
描述	GDSL esterase/lipase At4g16230-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	25437504 - 25441311 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024246`
GeneID	`131024246`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024246`
原始查询	`LOC131024246`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase At4g16230-like
产物	GDSL esterase/lipase At4g16230-like
Arabidopsis	`AT2G23540` (AT2G23540) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816886] identity=48.1; qcov=1; evalue=1.56e-130; confidence=high
Rice	`Os03g0310000` (OsGELP46) - identity=60.4; qcov=0.976; evalue=6.92e-163; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024246

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057809748.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809748.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809748.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809748.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809748.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:25437526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:25437535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr5:25437565`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	80	A13,A18,A19,A8,A9,B106,B11,B118,B120,B121,B123,B126,B130,B132,B134,B135,B136,B15,B2,B20,B24,B26,B27,B29,B3,B47,B5,B52,B55,B61,B62,B64,B67,B70,B71,B75,B78,B8,B81,B83,B87,B9,B93,B95,C16,C18,C2,C20,C23,C27,C29,C3,C32,C33,C35,C4,C40,C41,C45,C46,C47,C52,C55,C56,C58,C59,C60,C61,C65,C68,C71,C72,C79,C8,C81,C85,D10,D2,D3,D7
`Chr5:25437568`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	80	A13,A18,A19,A8,A9,B106,B11,B118,B120,B121,B123,B126,B130,B132,B134,B135,B136,B15,B2,B20,B24,B26,B27,B29,B3,B47,B5,B52,B55,B61,B62,B64,B67,B70,B71,B75,B78,B8,B81,B83,B87,B9,B93,B95,C16,C18,C2,C20,C23,C27,C29,C3,C32,C33,C35,C4,C40,C41,C45,C46,C47,C52,C55,C56,C58,C59,C60,C61,C65,C68,C71,C72,C79,C8,C81,C85,D10,D2,D3,D7
`Chr5:25437687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:25437935`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr5:25437935`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr5:25438745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B21
`Chr5:25438781`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A24,C42
`Chr5:25438781`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A24,C42
`Chr5:25438859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C28
`Chr5:25438915`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809748.1

370 aa

185

370

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 38-351 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809748.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	38	351	4e-34	119.3	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953765.1
ATGGGAAATCTATTACAAAAACCAATCTATGCTTTGTCCCAATTCTTGATTGTAATACTAATGTTTATTGTTGAGTTAAGGTTATGTTCTTCCGCAGCGGCACCAGCCAATTTCATTTTTGGAGATTCTCTAGTTGATGCTGGCAACAACAACTACATTGCTTCTCTATCTAAAGCAGATTTTGCCCCAAATGGGATCGATTTTGGCATGCCCACAGGCAGATACACCAACGGCAGAACCATAGTCGACATTTTAGGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024246
ATGGGAAATCTATTACAAAAACCAATCTATGCTTTGTCCCAATTCTTGATTGTAATACTAATGTTTATTGTTGAGTTAAGGTTATGTTCTTCCGCAGCGGCACCAGCCAATTTCATTTTTGGAGATTCTCTAGTTGATGCTGGCAACAACAACTACATTGCTTCTCTATCTAAAGCAGATTTTGCCCCAAATGGGATCGATTTTGGCATGCCCACAGGCAGATACACCAACGGCAGAACCATAGTCGACATTTTAGGACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809748.1
MGNLLQKPIYALSQFLIVILMFIVELRLCSSAAAPANFIFGDSLVDAGNNNYIASLSKADFAPNGIDFGMPTGRYTNGRTIVDILGQEIGLSGFTPPYLAPTTEGAAILQGVNYASGGGGIFNHTGKIFGGRLNLDAQLDNFANTRQAIISTIGEDAATNLFQNALFSIAIGSNDFINNYLTPVISKVEQHLVSPQSFVAAMISRFRTQLMRLKSMGAKNIIVANVGPIGCIPFQREMNPSAGNECVDFPNQLAQLFNAQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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