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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002191`

染色体: Chr01 坐标: 38061466-38062409 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002191`
名称	SmilChr01G002191
描述	uncharacterized SmilChr01G002191
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	38061466 - 38062409 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024292`
GeneID	`131024292`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024292`
原始查询	`LOC131024292`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine proteinases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840613]; symbol=AT1G37020; hit=AT1G37020; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Cysteine proteinases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840613]; symbol=AT1G37020; hit=AT1G37020; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G37020` (AT1G37020) Cysteine proteinases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840613] identity=29.2; qcov=0.694; evalue=8.72e-07; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016926 (protein desumoylation); GO:0016929 (deSUMOylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024292

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809791.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057809791.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809791.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809791.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809791.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:38061726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B30
`Chr1:38061820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:38061840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B42,B47,C35,C49,C66,C80
`Chr1:38061848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C14,C74
`Chr1:38061886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:38061976`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr1:38061976`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr1:38061992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C11,C14,C35,C69,C74
`Chr1:38062037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr1:38062073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B28,C58,C78
`Chr1:38062074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B53,B80
`Chr1:38062130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809791.1

173 aa

173

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 48-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809791.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	48	164	9.7e-15	55.7	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953808.1
TGATTTCAACAAAGACGTATCAAATCCAATAGTGAGAGATTGGTCGTGTATGGAGATGGTTTGTTGGTTGGGCTTGCGTAGTGATAACCTTGAGGAAATGGTGGGGACAGTGATGCCGTATGTCCGTGGCAGTCTTCCTTTCATAGGTGGGCTGGAATGGACGAATGCTAGACGTGTATTTGGTGTGGCACACATAAACAACAATCATTGGTGTTTCTATCAGATATGCATCCCCGAGCAGCGCATTGTTGTTTACGACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024292
ATGGAGATGGTTTGTTGGTTGGGCTTGCGTAGTGATAACCTTGAGGAAATGGTGGGGACAGTGATGCCGTATGTCCGTGGCAGTCTTCCTTTCATAGGTGGGCTGGAATGGACGAATGCTAGACGTGTATTTGGTGTGGCACACATAAACAACAATCATTGGTGTTTCTATCAGATATGCATCCCCGAGCAGCGCATTGTTGTTTACGACTCTCTGAACTATGACTGGGATACTGTAGCGGGGCATTTTGACAAGGTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809791.1
MEMVCWLGLRSDNLEEMVGTVMPYVRGSLPFIGGLEWTNARRVFGVAHINNNHWCFYQICIPEQRIVVYDSLNYDWDTVAGHFDKVRTNLPILCRLGRIWERCNYSNALMESWDVVKFENPPQQTNHSDCGIIAIKFMECCAYGVPVDGIKPERGPIFRRRYVVRLFNSSYEA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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