当前解析结果
SmilChr01G002193| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002193 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002193 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002193 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 38101451 - 38103341 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024309 |
|---|---|
| GeneID | 131024309 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024309 |
| 原始查询 | LOC131024309 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os02g0328500- identity=30.6; qcov=0.551; evalue=2.84e-17; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024309 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057809801.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809801.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809801.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809801.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057809801.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:38102133 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B117,B66 |
Chr1:38102133 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B117,B66 |
Chr1:38102137 |
T |
TAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B66 |
Chr1:38102137 |
T |
TAA |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr1:38102139 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B3,B76 |
Chr1:38102139 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B3,B76 |
Chr1:38102159 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A22,B46,B94,C65 |
Chr1:38102171 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,B17 |
Chr1:38102172 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B124,B45,C37,C48,C57 |
Chr1:38102172 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B124,B45,C37,C48,C57 |
Chr1:38102173 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B138,B47,B55,C53,C61 |
Chr1:38102179 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,B111,B21 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。