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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003033`

染色体: Chr05 坐标: 38013658-38015986 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003033`
名称	SmilChr05G003033
描述	NEP1-interacting protein-like 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	38013658 - 38015986 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024322`
GeneID	`131024322`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024322`
原始查询	`LOC131024322`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NEP1-interacting protein-like 1
产物	NEP1-interacting protein-like 1
Arabidopsis	`AT3G20395` (AT3G20395) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008015] identity=45; qcov=0.888; evalue=1.13e-49; confidence=medium
Rice	`Os10g0544600` - identity=40.5; qcov=0.874; evalue=6.87e-48; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12678 (zf-rbx1); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF14634 (zf-RING_5); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024322

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057809809.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057809809.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057809809.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057809809.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809809.1

223 aa

112

223

zf-rbx1

zf-RING_2

zf-RING_11

zf-C3HC4

zf-C3HC4_2

zf-RING_5

PF12678 zf-rbx1 170-220 aa PF13639 zf-RING_2 177-220 aa PF17123 zf-RING_11 178-206 aa PF00097 zf-C3HC4 178-219 aa PF13923 zf-C3HC4_2 178-219 aa PF14634 zf-RING_5 178-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809809.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	170	220	3.2e-10	40.8	RING-H2 zinc finger domain
`XP_057809809.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	177	220	1.4e-14	54.8	Ring finger domain
`XP_057809809.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	178	206	3.6e-09	36.9	RING-like zinc finger
`XP_057809809.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	178	219	7.8e-07	29.6	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057809809.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	178	219	6.3e-08	33.0	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057809809.1`	Pfam	`PF14634`	zf-RING_5	Domain	178	221	9.5e-07	29.4	zinc-RING finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953826.1
AAAATGAATAGTGTTTGCAGCATGCATGGGCGCAGCACGTGTGTGGTAGATCATGAGCTCCCAACCAGACTTTAATGCTCAACTTCTTTCCTCCTATAAATCCCACCCACATTTCTTCATGCTTTCATTCACTTCAATTTAATCCATCGCCAGATTTTATTCCAATTCCAACCGCTTAATAGAAAAAGGGGTTCTCACAATTACCGCCAACACTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAAAACAATTCCATCAAACTCTAAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024322
ATGTTGATCTGCTATCAAGCGATGAAAAGGTGGGCTTCCGCCGCCGCGCCTTGGATTCACACTGAGCTCAGCCGCTCCCAATTTGTCTTCGTCTTCGCGCTGCTCAAGAAATTCGCCGTCGCTCTACTCACTTGCATTTTCGCTCTCGGTGGAGCTATCGTAGGCGTAATTAGCGGAGCGCTGAAAGGGCAGACCACCGAAACCGGCCTACTGCGTGGGGTTGGTGTAGGGGCGGTAGCAGGGGCCATCACGGCCGTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809809.1
MLICYQAMKRWASAAAPWIHTELSRSQFVFVFALLKKFAVALLTCIFALGGAIVGVISGALKGQTTETGLLRGVGVGAVAGAITAVQLMELILNGEPFSKAALICSLVNGKIFMEWVSPAVLKAYQWQISTMETGLREISDIFEVNTIRGLSQDTIKELPSFEFNTAETAATCSDTSCAICLQDLRDGESTRLLPSCRHFFHIHCIDQWLSRQATCPVCRKDV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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