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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003139`

染色体: Chr05 坐标: 40004677-40006734 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003139`
名称	SmilChr05G003139
描述	purple acid phosphatase 18-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	40004677 - 40006734 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024400`
GeneID	`131024400`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024400`
原始查询	`LOC131024400`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	purple acid phosphatase 18-like
产物	purple acid phosphatase 18-like
Arabidopsis	`AT3G20500` (PAP18) purple acid phosphatase 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821596] identity=68.7; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0568900` (OsPAP18) - identity=68.8; qcov=0.899; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003993 (acid phosphatase activity); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00149 (Metallophos); PF14008 (Metallophos_C); PF16656 (Pur_ac_phosph_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024400

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057809880.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057809880.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809880.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809880.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809880.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:40004961`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A5,B104,B13,B4,C19,C34,C60
`Chr5:40004993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B103,C12,C57
`Chr5:40005234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:40005761`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B118
`Chr5:40005761`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B118
`Chr5:40005813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C60
`Chr5:40005912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B38,B75
`Chr5:40005935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B91
`Chr5:40006034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B136,B91,C33
`Chr5:40006092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,C42,D6
`Chr5:40006187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C22,C64,C66
`Chr5:40006237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B57,B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809880.1

435 aa

218

435

Pur_ac_phosph_N

Metallophos

Metallophos_C

PF16656 Pur_ac_phosph_N 45-132 aa PF00149 Metallophos 141-330 aa PF14008 Metallophos_C 345-403 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809880.1`	Pfam	`PF16656`	Pur_ac_phosph_N	Domain	45	132	1.9e-21	77.2	Purple acid Phosphatase, N-terminal domain
`XP_057809880.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	141	330	3.3e-18	67.5	Calcineurin-like phosphoesterase
`XP_057809880.1`	Pfam	`PF14008`	Metallophos_C	Domain	345	403	1.3e-20	74.5	Iron/zinc purple acid phosphatase-like protein C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953897.1
CACGGGAACTTTATAGCAAATTTCCCATTGATAAAATCAGAATCAAATACAGAATTCAGGTTTAATCCTAATTAATCTGTCACACCTAAATGAGCCTCTATATAAACTTCAACAGCCAAACAAATAAGTCGTATCGATCATGGCTTCAAAACTGTTCCTCACTGTGGCCGTAGTAGCAGCAGCGCTATCGTTCATCGCTGCGGCTGATTATGTCAGATCACCGCCACGCGAAATGCTTCGTTCCCCCTCGAGCTCAGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024400
ATGGCTTCAAAACTGTTCCTCACTGTGGCCGTAGTAGCAGCAGCGCTATCGTTCATCGCTGCGGCTGATTATGTCAGATCACCGCCACGCGAAATGCTTCGTTCCCCCTCGAGCTCAGAGCCGCCTTCTTCTCCACAGCAGGTTCACATCTCCTTGGCCGGAGCTAATCACATGCGGATCTCATGGATCACTAGCGACGAGAAATCTCCAAGCTTAGTCGAATACGGAATCTCGCCCAACAGCTACACCTCCAAAGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809880.1
MASKLFLTVAVVAAALSFIAAADYVRSPPREMLRSPSSSEPPSSPQQVHISLAGANHMRISWITSDEKSPSLVEYGISPNSYTSKAQGENTSYTYLTYKSGKIHHAVIGPLHDQTTYYYKCGGAGPEFQLRTLPSKLPVTLAVAGDLGQTGWTKSTLDHIARLQHDLLLLPGDLSYADYIQPAWDSFGQLVQPLASTRPWMVTQGNHDKEKIPVLEHSFLSYNSRWKMPYQESGSGSNLYYSFDVAGVHVIMLASYTDYD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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