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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003177`

染色体: Chr05 坐标: 40676471-40677958 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003177`
名称	SmilChr05G003177
描述	uncharacterized SmilChr05G003177
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	40676471 - 40677958 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024427`
GeneID	`131024427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024427`
原始查询	`LOC131024427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT1G13490; symbol=AT1G13490; hit=AT1G13490; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	AT1G13490; symbol=AT1G13490; hit=AT1G13490; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G13490` (AT1G13490) - identity=42.5; qcov=1.01; evalue=9.32e-96; confidence=medium
Rice	`Os08g0413100` (OSJNBa0007M04.25) - identity=39.5; qcov=1.06; evalue=4.07e-92; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06880 (DUF1262)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809919.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809919.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809919.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809919.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809919.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:40676581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr5:40677082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C76,D4
`Chr5:40677088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B52,B75,C2,C29,C7
`Chr5:40677120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D2
`Chr5:40677249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B52,C71
`Chr5:40677252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr5:40677548`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C41
`Chr5:40677548`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C41
`Chr5:40677549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B13
`Chr5:40677665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809919.1

404 aa

202

404

DUF1262

PF06880 DUF1262 22-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809919.1`	Pfam	`PF06880`	DUF1262	Family	22	142	1.1e-29	103.5	Protein of unknown function (DUF1262)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953936.1
AAATCTGAGCATAAAAGAGATCAAGGAAATCAAAATATGTACGTAACAAGGCCTCTGTCTGTGCTGCAAAAATCTGCAGAGAATCTTGCAGCGGCACCTGAGGGTCCGAACTCGGGATTCCTAGTGATTCAAGATGCGGAATCTGAGACGTATTCCATGTTTGGACTGAAGAAGAATCGGACGCTTAAGAAGTTGCCTTTCCCTCAAGACAAGGAGGTGGCCATTCTATATCCTAGAAGCTTGGGAGTCAGCGCCGGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024427
ATGTACGTAACAAGGCCTCTGTCTGTGCTGCAAAAATCTGCAGAGAATCTTGCAGCGGCACCTGAGGGTCCGAACTCGGGATTCCTAGTGATTCAAGATGCGGAATCTGAGACGTATTCCATGTTTGGACTGAAGAAGAATCGGACGCTTAAGAAGTTGCCTTTCCCTCAAGACAAGGAGGTGGCCATTCTATATCCTAGAAGCTTGGGAGTCAGCGCCGGCGTTTCTCTCCCCGTCGACGTCATCGGCGACGTCTCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809919.1
MYVTRPLSVLQKSAENLAAAPEGPNSGFLVIQDAESETYSMFGLKKNRTLKKLPFPQDKEVAILYPRSLGVSAGVSLPVDVIGDVSLDVATPSDSSHSVFFIPALNHPLSSNRYYALLSHGKHKGEALTSSKEQEDDAPCCFSSGITDAKPRPLDPNDAYQQFALFPGRASDTFSAKSAAADGVPPKFLRKKGWTATTKTPSSFKLGAAQGLDSQLRASLPELDSPGARAVGKWYAPFVFVKEGNSLRDQVERSMYYEVT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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