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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003178`

染色体: Chr05 坐标: 40684267-40686939 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003178`
名称	SmilChr05G003178
描述	uncharacterized SmilChr05G003178
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	40684267 - 40686939 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024430`
GeneID	`131024430`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024430`
原始查询	`LOC131024430`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT1G13490; symbol=AT1G13490; hit=AT1G13490; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	AT1G13490; symbol=AT1G13490; hit=AT1G13490; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G13490` (AT1G13490) - identity=43.3; qcov=1.01; evalue=1.61e-97; confidence=medium
Rice	`Os08g0413100` (OSJNBa0007M04.25) - identity=38.8; qcov=1.06; evalue=1.3e-88; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06880 (DUF1262)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024430

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809923.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809923.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809923.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809923.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809923.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:40684452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,A5,B121
`Chr5:40684454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr5:40684642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C4
`Chr5:40684674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:40684998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:40685099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr5:40685102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B33,C5
`Chr5:40685171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:40685284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr5:40685355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:40685438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809923.1

404 aa

202

404

DUF1262

PF06880 DUF1262 22-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809923.1`	Pfam	`PF06880`	DUF1262	Family	22	142	5e-29	101.3	Protein of unknown function (DUF1262)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953940.1
TAGGAATTTGCTTAACCAATATAAAATCAACACGTAGTATACAGTATTTATCATCAGTATTTATTCAGTAATCAACAAACACAACAAGAAGCAAAATCTGAGCAGAAAAGAGACGAAGAAAATCAAAATATGTACGTAACAAGGCCTCTGTCTGTGCTGCAAAAATCTGCAGAGAATCTTGCAGCGGCACCTGAGGGTCCGAACTCGGGATTCCTAGTGATTCAAGATGCGGAATCTGAGACGTATTCCATGTTTGGACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024430
ATGTACGTAACAAGGCCTCTGTCTGTGCTGCAAAAATCTGCAGAGAATCTTGCAGCGGCACCTGAGGGTCCGAACTCGGGATTCCTAGTGATTCAAGATGCGGAATCTGAGACGTATTCCATGTTTGGACTGAAGAAGAATCGGACGCTTAAGAAGTTGCCTTTCCCTCAAGACAAGGAGGTGGCCATTCTATATCCTAGAAGCTTGGGAGTCAGCGCCGGCGTTTCTCTCCCCGTCGACGTCATCGGCGACGTCTCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809923.1
MYVTRPLSVLQKSAENLAAAPEGPNSGFLVIQDAESETYSMFGLKKNRTLKKLPFPQDKEVAILYPRSLGVSAGVSLPVDVIGDVSLDVATPSDSSHSVFFIPALNHPLSSNRYYALLSHGKRKGEALTSSKEQEDDAPCCFSSGIVDAKPRPLDPNDAYQQFALFPGRSSDTFSAKSAAADGVPPKFLRKKGWTATTKTPSSFKLGAAQGLDSQLRASLPELDSPGARAVGKWYAPFVFVKEGNSLRDQVERSMYYEVT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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