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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003200`

染色体: Chr05 坐标: 40938388-40944809 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003200`
名称	SmilChr05G003200
描述	tRNA(adenine(34)) deaminase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	40938388 - 40944809 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024447`
GeneID	`131024447`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024447`
原始查询	`LOC131024447`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA(adenine(34)) deaminase, chloroplastic
产物	tRNA(adenine(34)) deaminase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G68720` (TADA) tRNA arginine adenosine deaminase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843202] identity=36.9; qcov=0.698; evalue=1.21e-129; confidence=medium
Rice	`Os06g0489500` - identity=68.1; qcov=0.188; evalue=1.06e-103; confidence=weak
GO	GO:0002100 (tRNA wobble adenosine to inosine editing); GO:0008251 (tRNA-specific adenosine deaminase activity); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF00383 (dCMP_cyt_deam_1); PF14437 (MafB19-deam)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024447

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057809935.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057809935.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057809935.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809935.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809935.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:40938753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr5:40938901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B13,B4,C76,D4
`Chr5:40939104`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C42
`Chr5:40939104`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C42
`Chr5:40939656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:40939922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr5:40939975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr5:40940038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C76
`Chr5:40940115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:40940203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B84,C30
`Chr5:40940961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B13,B4,C76,D4
`Chr5:40941794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B5,B67,C52,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809935.1

1263 aa

632

1263

dCMP_cyt_deam_1

MafB19-deam

PF00383 dCMP_cyt_deam_1 1063-1161 aa PF14437 MafB19-deam 1066-1163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809935.1`	Pfam	`PF00383`	dCMP_cyt_deam_1	Domain	1063	1161	1.1e-28	99.8	Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region
`XP_057809935.1`	Pfam	`PF14437`	MafB19-deam	Family	1066	1163	4e-25	89.0	MafB19-like deaminase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953952.1
AAGAAAGAAATATACGAAAACAGGGAAGAGAACACAAGAAAAACTTCCATCCTAAAATTCTGTGTGCCGTTGCTCACAGATCAGCTGCCGATCTTCGCATCTCCTCACTCTTCGTCAAGGTACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTTTCTTCTCTCTCTACGAATTTGAGCTATGCTCAACACTGGTATAGCTTCAGCAATCTCACTAAGAAGTAGAGGATCCCTTTCATTCACCACGACTGACTACTCACATTGCTCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024447
ATGCTCAACACTGGTATAGCTTCAGCAATCTCACTAAGAAGTAGAGGATCCCTTTCATTCACCACGACTGACTACTCACATTGCTCAAATGGACGAAGCCCTTTTGACTATTCATCGCTCACGCCTTGTTGTTCTTGCTGTTGTACTTCATCATATGCAGTACCCATTTGCCCCAATTATGGCTATAATTTATACGGGCTTAAGCAATCCTCTTTGATCCAATGGTCTTGTTACAGGCGACCGATTTCAAATGGATTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809935.1
MLNTGIASAISLRSRGSLSFTTTDYSHCSNGRSPFDYSSLTPCCSCCCTSSYAVPICPNYGYNLYGLKQSSLIQWSCYRRPISNGFDYYARLPACDIDRTCYCDKVSNFRETSVGRKRGELRKCFVYEERSEIYNLGGVDEAEAILSLLAEDIGEECFLETKETRRLVRKPVVEKRKNGSVCQECGSKKDIVEQGVSESGRGPMVSSRKDDSRRRKEMIQSEENKQAILREEHECSSLKNRREEREKEEREALLRKASQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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