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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003201`

染色体: Chr05 坐标: 40945498-40949172 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003201`
名称	SmilChr05G003201
描述	uncharacterized SmilChr05G003201
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	40945498 - 40949172 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024449`
GeneID	`131024449`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024449`
原始查询	`LOC131024449`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Zim17-type zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843204]; symbol=AT1G68730; hit=AT1G68730; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Zim17-type zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843204]; symbol=AT1G68730; hit=AT1G68730; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G68730` (AT1G68730) Zim17-type zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843204] identity=53.3; qcov=0.968; evalue=5.19e-30; confidence=medium
Rice	`Os06g0724400` (OsDNLZ1) - identity=57.1; qcov=0.589; evalue=1.06e-16; confidence=low
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006457 (protein folding); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0030150 (protein import into mitochondrial matrix); GO:0050821 (protein stabilization); GO:0051087 (protein-folding chaperone binding)
KEGG	-
Pfam	PF05180 (zf-DNL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024449

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809937.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057809938.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057809937.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809937.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809937.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:40946728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,D11
`Chr5:40947441`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A2,B112,B13,C44,C60,C62,C82,D3
`Chr5:40947978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:40947997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	95	A10,A2,A22,A4,A7,A8,B102,B105,B106,B110,B111,B117,B123,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B137,B138,B139,B16,B17,B18,B20,B22,B23,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B33,B34,B40,B44,B45,B48,B49,B50,B56,B58,B60,B66,B69,B70,B73,B81,B83,B86,B90,B95,B96,B97,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C21,C28,C30,C33,C34,C36,C40,C43,C44,C5,C50,C53,C54,C58,C63,C67,C71,C73,C76,C77,C80,C81,C82,C83,C84,C85,D1,D11,D2,D3,D6,D9
`Chr5:40948027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B34,B69,B73
`Chr5:40948069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C42,D6
`Chr5:40948350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B13,B4,C76,D4
`Chr5:40948368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr5:40948484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809937.1

177 aa

177

zf-DNL

PF05180 zf-DNL 118-165 aa

XP_057809938.1

95 aa

zf-DNL

PF05180 zf-DNL 36-83 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809937.1`	Pfam	`PF05180`	zf-DNL	Domain	118	165	3.5e-16	59.6	DNL zinc finger
`XP_057809938.1`	Pfam	`PF05180`	zf-DNL	Domain	36	83	9.2e-17	61.5	DNL zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953954.1
ATTTTTCAGAAACTAGTTAAACAAAACCGTCGTGAATTCAAGAACGCAGTGGAAAGAGGAACAACGAAATTGAAGGTTCTGTTCATCTTCTTCTGCTGTTGAAAATGGACGCCGCTAACAGCTTCAAATTTCTCGGATTTGATAATTATCTGTCCCTTGTGGCCAAAGCCCCTAAATTTTCTCTTCCATGTTCCCAATTATTCAGACCTAATTTAGGCGCCAAACATGGAGAGTTTACACTTCCGAGGTCATCTTCCATC...

XM_057953955.1
TTAAACAAAACCGTCGTGAATTCAAGAACGCAGTGGAAAGAGGAACAACGAAATTGAAGACCTAATTTAGGCGCCAAACATGGAGAGTTTACACTTCCGAGGTCATCTTCCATCGCCGTTCGCAGTAGTTGGAGGTCGAGGATCTCTTACCGAGGAAATGAGGGTGCGGAGCAATGTTTTAGAGTGCCAACCATTTCATGTTCGATGGTAGATGGCACTGGAGACTACAAAGAAATGGAGCAGTCCTCTTCAATGGATTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024449
ATGGACGCCGCTAACAGCTTCAAATTTCTCGGATTTGATAATTATCTGTCCCTTGTGGCCAAAGCCCCTAAATTTTCTCTTCCATGTTCCCAATTATTCAGACCTAATTTAGGCGCCAAACATGGAGAGTTTACACTTCCGAGGTCATCTTCCATCGCCGTTCGCAGTAGTTGGAGGTCGAGGATCTCTTACCGAGGAAATGAGGGTGCGGAGCAATGTTTTAGAGTGCCAACCATTTCATGTTCGATGGTAGATGGCAC...

LOC131024449
ATGGTAGATGGCACTGGAGACTACAAAGAAATGGAGCAGTCCTCTTCAATGGATTGCCGGCAGGAGGGTGTTATTGACTTGAAGCTCCCAAGAAGACGTTTGTTAGTAACTTTTACGTGTGATGCCTGTAATGCTCGGTCACAGAGGTTAATAAATAGACTAGCTTATGAACGTGGGCTTGTTTATGTGCAGTGTTCAGGATGTTCTCAGTACCACAAGCTTGTCGACAATCTTGGACTTGTTATCGAGTACAACTTGCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809937.1
MDAANSFKFLGFDNYLSLVAKAPKFSLPCSQLFRPNLGAKHGEFTLPRSSSIAVRSSWRSRISYRGNEGAEQCFRVPTISCSMVDGTGDYKEMEQSSSMDCRQEGVIDLKLPRRRLLVTFTCDACNARSQRLINRLAYERGLVYVQCSGCSQYHKLVDNLGLVIEYNLQEEIDTDQV

XP_057809938.1
MVDGTGDYKEMEQSSSMDCRQEGVIDLKLPRRRLLVTFTCDACNARSQRLINRLAYERGLVYVQCSGCSQYHKLVDNLGLVIEYNLQEEIDTDQV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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