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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003220`

染色体: Chr05 坐标: 41317710-41319903 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003220`
名称	SmilChr05G003220
描述	nudix hydrolase 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	41317710 - 41319903 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024461`
GeneID	`131024461`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024461`
原始查询	`LOC131024461`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nudix hydrolase 1-like
产物	nudix hydrolase 1-like
Arabidopsis	`AT1G68760` (NUDX1) nudix hydrolase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843207] identity=58.2; qcov=0.899; evalue=5.48e-53; confidence=high
Rice	`Os09g0553300` - identity=42.4; qcov=0.396; evalue=4.61e-08; confidence=low
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0006203 (dGTP catabolic process); GO:0035539 (8-oxo-7,8-dihydrodeoxyguanosine triphosphate pyrophosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00293 (NUDIX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024461

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809953.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809953.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809953.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809953.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809953.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:41318028`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A24,A25,A5,B126,B128,B130,B49,B51,B52,B81,B90,B92,C1,C44,C47,C51,C55,C65,C80,D11
`Chr5:41318044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr5:41319361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C48
`Chr5:41319414`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C44
`Chr5:41319414`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809953.1

149 aa

149

NUDIX

PF00293 NUDIX 10-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809953.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	10	126	1.2e-18	68.1	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953970.1
ATATTAGTCATGCTCTAAAATAATTAATGATCCAACCATATATAGAAAATAAACTTTAAATTTTAAGGGTATTATGTATACATAATATAGATTAATTGTTTATTTGTTTATTTTATAGCGCTTCAAAAAATAGTTCTATATATAGCGACTACAAAAACTGAAGAGTTCCTATCAACAAACAAATTAAATCCAGCTGTTGATTGCCCAAAAAAGGAAAAAAAAGGTCACCTTTTTTCTATTTGGCATTTTCTTGTATTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024461
ATGTCGTCGCCAGTGGCGCCACCGAAGCCAGTAGTTGGGGTGGGGGTTTTTCTGCTAAAGGATAATAAGGTGTTGCTCGGTCGCCGCCTCACCGCATTCGGCTACGGCACCTTCGCCCTTCCCGGCGGCCATCTCGAGTTCGGGGAGACATTCTCGGATTGTGCGGCGAGGGAAGTGAAGGAGGAAACAGGGCTAGAGATTAGTGGAGCAGAGTTGTTGACTGTGACCAACACCGTGCTCTCGCAGCCCAAACCAGTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809953.1
MSSPVAPPKPVVGVGVFLLKDNKVLLGRRLTAFGYGTFALPGGHLEFGETFSDCAAREVKEETGLEISGAELLTVTNTVLSQPKPVQLIAILMRAALADADQTAINAEPDKCEGWDWYDWEHLPTPLFASLETAISQGLNPFPFPFPSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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