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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003388`

染色体: Chr05 坐标: 44909436-44910312 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003388`
名称	SmilChr05G003388
描述	agamous-like MADS-box protein AGL61
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	44909436 - 44910312 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024485`
GeneID	`131024485`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024485`
原始查询	`LOC131024485`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agamous-like MADS-box protein AGL61
产物	agamous-like MADS-box protein AGL61
Arabidopsis	`AT2G24840` (AGL61) AGAMOUS-like 61 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817021] identity=26.6; qcov=1.12; evalue=3.56e-15; confidence=low
Rice	`Os12g0407000` (OsMADS73) - identity=47.8; qcov=0.457; evalue=3.32e-17; confidence=low
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00319 (SRF-TF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024485

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809976.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057809976.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809976.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809976.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809976.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:44909747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:44909821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B122,B37,C38,C44
`Chr5:44909839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:44909870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B46,B53
`Chr5:44909892`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B102,B122,B37,C38
`Chr5:44909892`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B102,B122,B37,C38
`Chr5:44909930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr5:44909993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr5:44910013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B138,C3,C8
`Chr5:44910084`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C44
`Chr5:44910084`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C44
`Chr5:44910099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809976.1

151 aa

151

SRF-TF

PF00319 SRF-TF 11-57 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809976.1`	Pfam	`PF00319`	SRF-TF	Domain	11	57	7.4e-13	48.4	SRF-type transcription factor (DNA-binding and dimerisation domain)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953993.1
GCGAAACCCCCCGAGTTGGTACCGGCGTTCCATATACTTTGCGGTTGATCACATTTTTAGAATATAAGAGAGATATTATGGCCATTATGAGATTCGCAATAAATTTGGGACTTAAACAGGCCTGCCATTAATAAAGTTTTTTTTTTTTTTTAAATACTGAAATAGCCAATTATGGTCGCCTATATTTGAACCCGATGTAGCCGGCCATCAAATTAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGTGAGAAACCCAATCAAGAAACCCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024485
ATGGGGAGGAGAAGGATTGAGATCACGCTGATCCCGGACAAGTCAAAACGACACACGACCTTCACGAAACGGCGGAACGGCCTCACAAAGATAGCCTATGAATTCTGCCGGAAGTTCGACTCCACGGCGGTGCTCCTCATCTTCTCCTCCTCCCAAAACTGCTACGCCTTCGGCCATCCAGAAATCGACTCCGTCTTGAACCGCTACGAGGTCGACTCCTCTTCGGCAGAAGCGGGGACCAGCGCCGCCGAGGAACGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809976.1
MGRRRIEITLIPDKSKRHTTFTKRRNGLTKIAYEFCRKFDSTAVLLIFSSSQNCYAFGHPEIDSVLNRYEVDSSSAEAGTSAAEERAVTEMERRIGNAVESGRWEEAVRGLGLDAFDQLTAELENIRRQVAAFQTKFAAAPEEETQDPGRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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