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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003390`

染色体: Chr05 坐标: 44926187-44927694 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003390`
名称	SmilChr05G003390
描述	uncharacterized SmilChr05G003390
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	44926187 - 44927694 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024487`
GeneID	`131024487`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024487`
原始查询	`LOC131024487`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842742]; symbol=AT1G64355; hit=AT1G64355; species=arabidopsis; confidence=high
产物	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842742]; symbol=AT1G64355; hit=AT1G64355; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G64355` (AT1G64355) 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842742] identity=76.3; qcov=0.884; evalue=1.22e-57; confidence=high
Rice	`Os05g0571400` - identity=59.5; qcov=0.977; evalue=1.78e-45; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12159 (DUF3593)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024487

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809978.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057809979.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057809979.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057809978.1`
5	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057809978.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:44926574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr5:44927476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809978.1

190 aa

190

DUF3593

PF12159 DUF3593 85-170 aa

XP_057809979.1

129 aa

129

DUF3593

PF12159 DUF3593 24-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809978.1`	Pfam	`PF12159`	DUF3593	Family	85	170	5.9e-33	113.5	Protein of unknown function (DUF3593)
`XP_057809979.1`	Pfam	`PF12159`	DUF3593	Family	24	109	2.3e-33	114.8	Protein of unknown function (DUF3593)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953995.1
TGCAAGCCTGCGGTAAGTTGCAATGAATTTTATTGTAATTATCCCAATCAAATTAATTTCAAGTCGAAGAATTTGAACCCCAATACCCAACAAAAGCTGGATTTTCCATTGCAAATAGATAAGGCTGCTGAAGTTTCAGTTGTTCAACCAATTCGTATCGAATTCAAGAAGCCACTGCTCGTAATTCCCTGCGAGTTATAATCCACAGCTCTGCAATGGTTAGCTATCCGCATATTCAAATCCGCTTCAGGAATCCAGTA...

XM_057953996.1
GCAAGCCTGCGGTAAGTTGCAATGAATTTTATTGTAATTATCCCAATCAAATTAATTTCAAGTCGAAGAATTTGAACCCCAATACCCAACAAAAGCTGGATTTTCCATTGCAAATAGATAAGGCTGCTGAAGTTTCAGTTGTTCAACCAATTCGTATCGAATTCAAGAAGCCACTGCTCGTAATTCCCTGCGAGTTATAATCCACAGCTCTGCAATGCTTCAGAGAAAATTCATGGAGCTCCACCCTCACTTTGAAGAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024487
ATGGTTAGCTATCCGCATATTCAAATCCGCTTCAGGAATCCAGTATTTCTGGTTTCATCCTTGTTCAACGATTGCAGCTTCAGAGAAAATTCATGGAGCTCCACCCTCACTTTGAAGAAGCAATTCCAACTCAAATACTGGGCTCAAACTGTAAACATAAGATCTCGAAGAAGCGGAAAAGCCATGGTGTGCGGTGGGATTATGTTTCCAATCGATTCATGGGCGGCGGACGTTGATTCTCCGGCGATTGCTTCGCAGCT...

LOC131024487
ATGGTGTGCGGTGGGATTATGTTTCCAATCGATTCATGGGCGGCGGACGTTGATTCTCCGGCGATTGCTTCGCAGCTCTCTGCTTTCTCTCTCTTACCTTATTTCGGTTTCTTGTATTTTATCACCAAATCAAAATCTGCCCCAGCCCTCACGCTTTTTGGATTCTACTTCTTGCTCGCCTTTGTGGCTGCCGCCATTCCAGCAGGAATCTATGCAAAGGTACACTATGTGAAATCCTTGGCCAATGTCGACTGGTTGCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809978.1
MVSYPHIQIRFRNPVFLVSSLFNDCSFRENSWSSTLTLKKQFQLKYWAQTVNIRSRRSGKAMVCGGIMFPIDSWAADVDSPAIASQLSAFSLLPYFGFLYFITKSKSAPALTLFGFYFLLAFVAAAIPAGIYAKVHYVKSLANVDWLHGGAESLLMFTNLFIVLGLRKALREAQHQSVTSQVKDEEQSPV

XP_057809979.1
MVCGGIMFPIDSWAADVDSPAIASQLSAFSLLPYFGFLYFITKSKSAPALTLFGFYFLLAFVAAAIPAGIYAKVHYVKSLANVDWLHGGAESLLMFTNLFIVLGLRKALREAQHQSVTSQVKDEEQSPV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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