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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003406`

染色体: Chr05 坐标: 45155778-45163958 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003406`
名称	SmilChr05G003406
描述	mitochondrial inner membrane protein OXA1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45155778 - 45163958 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024498`
GeneID	`131024498`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024498`
原始查询	`LOC131024498`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial inner membrane protein OXA1-like
产物	mitochondrial inner membrane protein OXA1-like
Arabidopsis	`AT5G62050` (OXA1) inner membrane OXA1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836325] identity=56.2; qcov=0.768; evalue=1.84e-133; confidence=high
Rice	`Os10g0521300` - identity=63.3; qcov=0.504; evalue=7.78e-108; confidence=medium
GO	GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0032977 (membrane insertase activity); GO:0032979 (protein insertion into mitochondrial inner membrane from matrix); GO:0033617 (mitochondrial respiratory chain complex IV assembly)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02096 (60KD_IMP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024498

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057809986.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057809986.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057809986.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809986.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809986.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45156141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B136,C33
`Chr5:45156167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:45156366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B40
`Chr5:45157192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B48,B65,B93
`Chr5:45158329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B40
`Chr5:45158552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,C62,C82
`Chr5:45163218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:45163385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B136,C33
`Chr5:45163520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,D4
`Chr5:45163567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr5:45163568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B79,C34,C39,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809986.1

470 aa

235

470

60KD_IMP

PF02096 60KD_IMP 165-366 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809986.1`	Pfam	`PF02096`	60KD_IMP	Domain	165	366	6.2e-33	114.9	60Kd inner membrane protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954003.1
TTCGAAATCCCCCTATTTTGATCTTAAATCGTGTTAGCAGAAGACCGAGTACAGCTCGGAATATCTGAAGCTGCAACACCTTCTCTGTCACCAGCAACAACAGCACCTCAAAAACCCCTAACCCGCTAAACCCTTGTTGTCTGGAGATCTTTTTCCTTCAATTGAATCCACACAGGACGCATTAATGGCTTTCAGACGGAGCGTTACCTCACGCGCTAAAATTCTCTATCAACAGCAACGAGTCGCCGTTCCATTTTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024498
ATGGCTTTCAGACGGAGCGTTACCTCACGCGCTAAAATTCTCTATCAACAGCAACGAGTCGCCGTTCCATTTTCGCATATCGATCGTGACGATGGCGACCGCGAAAATTTACCCCGTCATAACCCCATTTACACGGGCAGTGGGATCCCTGATATTCCGCGGCGGCGCAGCCCGTTCGGGGCCGGGGCAAATGTAGGAGGTTTTTGTGGGTCGAGGCTGTTCCAAGATCGGAGATTTGCGATTCCAGCTGCTTTCGCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809986.1
MAFRRSVTSRAKILYQQQRVAVPFSHIDRDDGDRENLPRHNPIYTGSGIPDIPRRRSPFGAGANVGGFCGSRLFQDRRFAIPAAFAPASVRKMSSLKEGPGADNIELMTDMADDKIGIMTDMADVLGETAAQVAQATAPVAGEVAAAAADSFFPVAALQYIIDYVHTFTGLNWWAAIVLTTVLIRTLQLPLTIHQIKATSKFTLIRPELEKIQEEMRSRDMSPAAVLEGQAKMRKIFNEYGVTPFTPLKGILIVGPVFLC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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