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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003430`

染色体: Chr05 坐标: 45538514-45541644 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003430`
名称	SmilChr05G003430
描述	phosphatidylinositol 4-kinase gamma 4-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45538514 - 45541644 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024520`
GeneID	`131024520`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024520`
原始查询	`LOC131024520`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylinositol 4-kinase gamma 4-like
产物	phosphatidylinositol 4-kinase gamma 4-like
Arabidopsis	`AT2G46500` (PI4K GAMMA 4) phosphoinositide 4-kinase gamma 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819260] identity=56.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0590100` - identity=53.9; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00240 (ubiquitin); PF00454 (PI3_PI4_kinase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024520

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057810009.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057810009.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057810009.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810009.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810009.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45538769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C25,D9
`Chr5:45538820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr5:45538982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr5:45539066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:45539093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A3,B21
`Chr5:45539096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr5:45539097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr5:45539244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr5:45539265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr5:45539366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr5:45539411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,C24,C3
`Chr5:45539566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810009.1

580 aa

290

580

ubiquitin

PI3_PI4_kinase

PF00240 ubiquitin 38-106 aa PF00240 ubiquitin 112-184 aa PF00454 PI3_PI4_kinase 274-528 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810009.1`	Pfam	`PF00240`	ubiquitin	Domain	38	106	2.7e-20	72.6	Ubiquitin family
`XP_057810009.1`	Pfam	`PF00240`	ubiquitin	Domain	112	184	2.7e-20	72.6	Ubiquitin family
`XP_057810009.1`	Pfam	`PF00454`	PI3_PI4_kinase	Family	274	528	1.2e-51	176.6	Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954026.1
ACTATAAAGTTTGTAGCTTATAAGAAGACCGTTAAACATGCAAAGAAATTAAAATCGTATGAAAGAAGCATGAAGCTAAGGCAACGGCTATAATTCCGCTCTCTTTCCCATCCATCCATTCTTCCACAGTTTTAGCTGAACCTTCAAAACCGCTCCTCCATCAATCCCATAAAGTTGTATTATTATTGTCTCATAAGTTCCTTTGAATATCCTGCATGCCGGAATGAGGCAAAAATTGTCGAGGAATAAATTATCAGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024520
ATGTCTGCTGTTGACATTGCTATGAGTCCAATCTTGGACGGGACAACACAATATGCCGGTTGTTTTAAGGACCGGCTTGATCTTTGCTCTAGTGAATCTATCAAGATCTACATCACCGTTGGGGGTTCCTCGACCCCCATGCGTATGATGGAGTCAGATTCCATTGCATCAGTGAAGCTTAGGATACAGGAATGTAAAGGTTTTGTAGTGAAGAGTCAGAAGCTAGTTTTTGGAGGCAGGGAACTCTCAAGGACTAATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810009.1
MSAVDIAMSPILDGTTQYAGCFKDRLDLCSSESIKIYITVGGSSTPMRMMESDSIASVKLRIQECKGFVVKSQKLVFGGRELSRTNSLVKDYGIGDGNALHLALRVSDILMINVRTACGEEFEFQVDKHRNVGYLKRRIAKKGKGFHDVHPEIFCHGVKLQDDDRLIGDLSNSSDAVLHLVVHKYAEVWSKTVERDVELSITSPDSNNRMEGICEEKSKGRSILSRTLLGQDFFLKPVIVSPSVEFPHFLWKMAQSVSDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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