当前解析结果
SmilChr01G002340| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002340 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002340 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002340 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 40570671 - 40573529 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024529 |
|---|---|
| GeneID | 131024529 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024529 |
| 原始查询 | LOC131024529 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240444]; symbol=AT2G35658; hit=AT2G35658; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240444]; symbol=AT2G35658; hit=AT2G35658; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT2G35658 (AT2G35658)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240444] identity=45.4; qcov=1.05; evalue=2.51e-19; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024529 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057810023.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057810023.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.60000 | XP_057810035.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057810023.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810023.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:40571011 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B38,B39,B91 |
Chr1:40571020 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D5 |
Chr1:40571023 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B38,B39,B91 |
Chr1:40571057 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr1:40573094 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B109,B138,B9,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。