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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003448`

染色体: Chr05 坐标: 45858837-45860514 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003448`
名称	SmilChr05G003448
描述	uncharacterized SmilChr05G003448
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45858837 - 45860514 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024535`
GeneID	`131024535`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024535`
原始查询	`LOC131024535`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0235100; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0235100; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G42070` (AT5G42070) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834212] identity=77.9; qcov=0.405; evalue=6.2e-37; confidence=low
Rice	`Os01g0235100` - identity=67; qcov=0.577; evalue=8.39e-44; confidence=medium
GO	GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024535

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810029.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057810029.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057810029.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810029.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810029.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45859040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B68,C35,C48
`Chr5:45859058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B93,D10
`Chr5:45859149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B122
`Chr5:45859164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C6,C83
`Chr5:45859176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,C83
`Chr5:45859885`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B118
`Chr5:45859885`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B118
`Chr5:45859999`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B16,B6,C39,C56,C67
`Chr5:45859999`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B16,B6,C39,C56,C67
`Chr5:45860094`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A25,B11,B45,B52,C24,C28,C3,C44,C8
`Chr5:45860111`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A25,B11,B45,B52,C24,C28,C3,C44,C8
`Chr5:45860127`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A16,B108,B122,B131,B46,B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954047.1
TCAAATAAACTATTTACAAGATAAAACGAAACGACTACTGAGAGAGAGGAATTGAAATCAGTGGTTGGAATTATCCATGTAACTTATCTTCCTCCCACCACACACAGAGAGAGAAGGCCGATTATGGCTGCCACCGCCGTCACCGGCACCACCTTCTTCCCTTCCTCTCTCCCAAAACCACCGCCCTCCCATAAATTCTTTCCCTCATCCCGACACTTTCTCAAAATCACTGCACCTCTGGCTCTGGTTAGTACGGCAAT...

XM_057954046.1
AACGAAACGACTACTGAGAGAGAGGAATTGAAATCAGTGGTTGGAATTATCCATGTAACTTATCTTCCTCCCACCACACACAGAGAGAGAAGGCCGATTATGGCTGCCACCGCCGTCACCGGCACCACCTTCTTCCCTTCCTCTCTCCCAAAACCACCGCCCTCCCATAAATTCTTTCCCTCATCCCGACACTTTCTCAAAATCACTGCACCTCTGGCTCTGGTTAGTACGGCAATCACCCCACCTTCTGTTTCATCGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024535
ATGGCTGCCACCGCCGTCACCGGCACCACCTTCTTCCCTTCCTCTCTCCCAAAACCACCGCCCTCCCATAAATTCTTTCCCTCATCCCGACACTTTCTCAAAATCACTGCACCTCTGGCTCTGGTTAGTACGGCAATCACCCCACCTTCTGTTTCATCGCCTGAAACTAGCGTTGTTGCTCAACAAGAAGAAGAAGAAGAAGCGGAGCAAAGTGATGATTCGAGCTCGGCATCTCTCCCTCCTCTCACGGGGTGTAAAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810029.1
MAATAVTGTTFFPSSLPKPPPSHKFFPSSRHFLKITAPLALVSTAITPPSVSSPETSVVAQQEEEEEAEQSDDSSSASLPPLTGCKGCGREEIERGCNGEGRIQGGIATVPGFGWWPIKAYRPCPAYLQSGGRYRRSGQSMDEVVSGRGATVKVIKIHHSFITAFHISFLDLRWLIITSKCISTAKLVSSDFRGLCLEPDYISNLLLYLK

XP_057810030.1
MAATAVTGTTFFPSSLPKPPPSHKFFPSSRHFLKITAPLALVSTAITPPSVSSPETSVVAQQEEEEEAEQSDDSSSASLPPLTGCKGCGREEIERGCNGEGRIQGGIATVPGFGWWPIKAYRPCPAYLQSGGRYRRSGQSMDEVVSGRGATVKQQNSKRKDLGESRGN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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