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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003494`

染色体: Chr05 坐标: 46473173-46478246 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003494`
名称	SmilChr05G003494
描述	altered inheritance of mitochondria protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	46473173 - 46478246 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024540`
GeneID	`131024540`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024540`
原始查询	`LOC131024540`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	altered inheritance of mitochondria protein 3-like
产物	altered inheritance of mitochondria protein 3-like
Arabidopsis	`AT4G20020` (MORF1) multiple organellar RNA editing factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827747] identity=40.1; qcov=0.303; evalue=5.97e-39; confidence=low
Rice	`Os11g0216400` - identity=50.3; qcov=0.162; evalue=5.03e-42; confidence=weak
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0016554 (cytidine to uridine editing); GO:0080156 (mitochondrial mRNA modification)
KEGG	-
Pfam	PF21864 (MORF_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024540

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057810032.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810032.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057810032.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810032.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810032.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:46474522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr5:46474523`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B70,B82,C72,C78,D2
`Chr5:46474523`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B70,B82,C72,C78,D2
`Chr5:46474682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D4,D9
`Chr5:46474746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B50,C12,C25
`Chr5:46474922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr5:46474934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C41
`Chr5:46475089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:46475183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr5:46475184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr5:46475442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr5:46475525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810032.1

1103 aa

552

1103

MORF_dom

PF21864 MORF_dom 84-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810032.1`	Pfam	`PF21864`	MORF_dom	Domain	84	174	1.2e-25	89.8	Multiple organellar RNA editing factor 1, MORF domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101902.1
TATTTGTTTCGAACTTTCGAGGGATCAAAGATCACCACCAAAGCCCTAAACTCCTTCGCTCCTTTTCATACATCATCATCAATGGCTCTTCACCTTCGTCGCCTCCACCGCGCTCTTTCCCAATCATATTTCCTACTCGAGCACTCTTTCCATGGCCGCACAGCCAAACTAATCTCCTCGACCTCCGCCCCTCGGTTTCTTCCAACCCCCGCCGCCACTACGCAGTTCATGCGGCGGCCTTTCACTTCAACCCCCACTCT...

XM_057954049.1
TATTTGTTTCGAACTTTCGAGGGATCAAAGATCACCACCAAAGCCCTAAACTCCTTCGCTCCTTTTCATACATCATCATCAATGGCTCTTCACCTTCGTCGCCTCCACCGCGCTCTTTCCCAATCATATTTCCTACTCGAGCACTCTTTCCATGGCCGCACAGCCAAACTAATCTCCTCGACCTCCGCCCCTCGGTTTCTTCCAACCCCCGCCGCCACTACGCAGTTCATGCGGCGGCCTTTCACTTCAACCCCCACTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024540
ATGGCTCTTCACCTTCGTCGCCTCCACCGCGCTCTTTCCCAATCATATTTCCTACTCGAGCACTCTTTCCATGGCCGCACAGCCAAACTAATCTCCTCGACCTCCGCCCCTCGGTTTCTTCCAACCCCCGCCGCCACTACGCAGTTCATGCGGCGGCCTTTCACTTCAACCCCCACTCTATTCCGCAGGGCATTCAATCCGGAGACAGATGAAATCAGGCCCGACGCCGTCCTCTTCGAAGGATGCGATTACAACCACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810032.1
MALHLRRLHRALSQSYFLLEHSFHGRTAKLISSTSAPRFLPTPAATTQFMRRPFTSTPTLFRRAFNPETDEIRPDAVLFEGCDYNHWVITVDVHKDSNITFDQMIETYVNIAAQVFGSVEEAKKRIYALSTCQGFKVECSEETSEKFRSIPAVSFVLPDSYIDPAIKEYEGDKYVNGEIFPRPPTVHYGPPSQQNYGQPPPQQNYGQPPPLQQSYRQPPPLLQNYRHPPPQQNYGQPPPPPPPQQYYGPPPPQQYYGQPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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