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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003516`

染色体: Chr05 坐标: 46974054-46983052 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003516`
名称	SmilChr05G003516
描述	protein IWS1 homolog 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	46974054 - 46983052 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024546`
GeneID	`131024546`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024546`
原始查询	`LOC131024546`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IWS1 homolog 1-like
产物	protein IWS1 homolog 1-like
Arabidopsis	`AT1G32130` (IWS1) Transcription elongation factor (TFIIS) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840105] identity=45.2; qcov=1.04; evalue=5.57e-120; confidence=high
Rice	`Os01g0147200` (IWS1) - identity=55.8; qcov=0.696; evalue=5.2e-114; confidence=high
GO	GO:0009742 (brassinosteroid mediated signaling pathway); GO:0032784 (regulation of DNA-templated transcription elongation)
KEGG	-
Pfam	PF08711 (Med26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024546

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810043.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810043.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810043.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810043.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810043.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:46974859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr5:46975216`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B28,B70,B82,C78
`Chr5:46975216`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B28,B70,B82,C78
`Chr5:46977187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr5:46980369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr5:46980611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:46980809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:46981682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C3
`Chr5:46982017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:46982125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr5:46982159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,A3,B54,B87
`Chr5:46982283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,A3,B54,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810043.1

532 aa

266

532

Med26

PF08711 Med26 335-377 aa

XP_057810044.1

507 aa

254

507

Med26

PF08711 Med26 335-377 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810043.1`	Pfam	`PF08711`	Med26	Domain	335	377	2.8e-11	43.8	TFIIS helical bundle-like domain
`XP_057810044.1`	Pfam	`PF08711`	Med26	Domain	335	377	2.5e-11	43.9	TFIIS helical bundle-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954060.1
GAAACAAATATCCTTCAAACAAAAATAATAGGACTATACACTCCTTCCTTCTCCCTCACACACACACGCACACGCGCACACACACACACGCACACGCACACGCAGACGCGGGGAGAGGGAAGTCATTCGGCTCCCTAAATCCGAAACTAGGAACTTCATAATCCATTTTCCCGCCAATTTATCAATTTCTTTGCGTGAAATCGTTACATGCCATGGTCTCCGCACCGAATCCCCTCTGTCATCTCGACCACATGGATTTT...

XM_057954061.1
CACTCCTTCCTTCTCCCTCACACACACACGCACACGCGCACACACACACACGCACACGCACACGCAGACGCGGGGAGAGGGAAGTCATTCGGCTCCCTAAATCCGAAACTAGGAACTTCATAATCCATTTTCCCGCCAATTTATCAATTTCTTTGCGTGAAATCGTTACATGCCATGGTCTCCGCACCGAATCCCCTCTGTCATCTCGACCACATGGATTTTTGTTTCATCTTCGCTACCCAGGAATCCCTCAACAACCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024546
ATGGAGCATGAGAACGAACCTTACCGTGATGAAGATGGCAAGCTGTTGGTGGACTTAGACAAGAATGTCGGATCTGAAGGGAATGTTGCTGGCTCTAACCACAATGAGAGACCCCCAACTCCAGTGTATGATGGCTCAAATTCGAAGTGTCGGAAGCTAGTCATAAAAATAAAATCTGGTGTAGGATCAGTTCCCGCCCCAACTCCAGTGAATAATGACTCAAATTCAAAATGTCGGAAGCTACTCATAAAATTTAAATC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810043.1
MEHENEPYRDEDGKLLVDLDKNVGSEGNVAGSNHNERPPTPVYDGSNSKCRKLVIKIKSGVGSVPAPTPVNNDSNSKCRKLLIKFKSDRESGPVLDGDGVQELVRDDYTDGRKGMKKKKKGENRRSMGKKGKVEKGEKKPRVRKRGGEERAHDEDDEIKEMWDAIVGGNCEDDNDDVRTGDEDKPIDDSGVDPSHHYGSDNEHSPNQVSQPEVETEDNEIENLFKFGKKKKKETSPSATRLLVDSVLAELNLAAVQDAEL...

XP_057810044.1
MEHENEPYRDEDGKLLVDLDKNVGSEGNVAGSNHNERPPTPVYDGSNSKCRKLVIKIKSGVGSVPAPTPVNNDSNSKCRKLLIKFKSDRESGPVLDGDGVQELVRDDYTDGRKGMKKKKKGENRRSMGKKGKVEKGEKKPRVRKRGGEERAHDEDDEIKEMWDAIVGGNCEDDNDDVRTGDEDKPIDDSGVDPSHHYGSDNEHSPNQVSQPEVETEDNEIENLFKFGKKKKKETSPSATRLLVDSVLAELNLAAVQDAEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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