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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003458`

染色体: Chr05 坐标: 46004802-46006161 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003458`
名称	SmilChr05G003458
描述	uncharacterized SmilChr05G003458
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	46004802 - 46006161 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024553`
GeneID	`131024553`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024553`
原始查询	`LOC131024553`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Glutaredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842758]; symbol=AT1G64500; hit=AT1G64500; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Glutaredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842758]; symbol=AT1G64500; hit=AT1G64500; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G64500` (AT1G64500) Glutaredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842758] identity=50.7; qcov=1.11; evalue=2.66e-106; confidence=high
Rice	`Os01g0235900` (OsGRL1) - identity=47.7; qcov=0.637; evalue=2.36e-47; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00462 (Glutaredoxin); PF23733 (GRXCR1-2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024553

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810052.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057810052.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057810052.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057810052.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810052.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:46005077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D2
`Chr5:46005116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B27
`Chr5:46005125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C60
`Chr5:46005130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:46005196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr5:46005292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:46005350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:46005382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B53,C61
`Chr5:46005407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:46005416`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C6
`Chr5:46005416`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C6
`Chr5:46005476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B35,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810052.1

336 aa

168

336

Glutaredoxin

GRXCR1-2_C

PF00462 Glutaredoxin 193-259 aa PF23733 GRXCR1-2_C 292-335 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810052.1`	Pfam	`PF00462`	Glutaredoxin	Domain	193	259	1.9e-11	44.7	Glutaredoxin
`XP_057810052.1`	Pfam	`PF23733`	GRXCR1-2_C	Domain	292	335	6.9e-15	55.4	GRXCR1/2, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954069.1
AAACACAATACCACAAACATATTTAAGGCCACAAAAACATTATAAACAATAATACTAGCAAGATAGATAAACAATACAACAAGTAATAATGAAGATAAAGGCCTCTACCATCCCACCACACAGTCACAAACACTTCCCCTTTCCCTCCAAAAATCGCACGCCACAATGGGGTGCACCTCATCCAAGCGAATCGAGGTCGCCGTCGACGCCTACCGCCCCCCGCCGTCGAGCTTCGCCGTCTTCGACGTCAACGCCATCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024553
ATGGGGTGCACCTCATCCAAGCGAATCGAGGTCGCCGTCGACGCCTACCGCCCCCCGCCGTCGAGCTTCGCCGTCTTCGACGTCAACGCCATCGAGGAGCCCTGGCTCAAGGACGGCAGCGACGCCGACCGGGACGACGAGAAGCCTCCGCCCGTGCCGCCCCCACTCCTCGACAAGCTCAACGGCGCCATCGACGCCGCCCCCCGCACCTGGGATGAAGTCAGCAAGGCGCTCGAGGATCTCAAGCCCAAACTCGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810052.1
MGCTSSKRIEVAVDAYRPPPSSFAVFDVNAIEEPWLKDGSDADRDDEKPPPVPPPLLDKLNGAIDAAPRTWDEVSKALEDLKPKLAAAALPPPPPNPVEAESPAAAPQAMRKNFSFHTLEELETKVAAKPVSEKKRVEPAAAVVAVARSLKDNIFIQKDREEREKEGRGAGFVRRDPLGDFEAICPPGGEDAVVVYTTSLGGVRRTYEDCNRVRQLMETYQVVFDERDVALDGGFRGELRGLVGEGAAVPRVFVKGRYIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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