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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003500`

染色体: Chr05 坐标: 46653094-46656656 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003500`
名称	SmilChr05G003500
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8 homolog A
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	46653094 - 46656656 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024558`
GeneID	`131024558`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024558`
原始查询	`LOC131024558`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8 homolog A
产物	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8 homolog A
Arabidopsis	`AT1G64520` (RPN12a) regulatory particle non-ATPase 12A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842760] identity=80.2; qcov=1; evalue=8.29e-153; confidence=high
Rice	`Os07g0435100` (OsRPN12) - identity=81.3; qcov=1; evalue=5.93e-157; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0005838 (proteasome regulatory particle); GO:0008541 (proteasome regulatory particle, lid subcomplex); GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10075 (CSN8_PSD8_EIF3K)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024558

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810056.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057810056.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057810056.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810056.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810056.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:46654375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:46654386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr5:46655239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810056.1

267 aa

134

267

CSN8_PSD8_EIF3K

PF10075 CSN8_PSD8_EIF3K 105-242 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810056.1`	Pfam	`PF10075`	CSN8_PSD8_EIF3K	Family	105	242	2.5e-30	106.1	CSN8/PSMD8/EIF3K family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954073.1
ATGGATGATCCGGACCGCGAAACCCGATTTAAATCTGGTATCTGTAGTTCAGCTTGCTTTCTTGGGCAGAAAGAATTCTTCGCGAGACCTACAAAACGGAATTCGGCGAGAAGATAAATCGATATAGAGAAATGGATCCGAGAACTACAGAGGTTTCCCAACTGTTCGAGCGATTCAAAGCGGCTATTGTCCGCAAAGATTTTGATACTTGTACCCAACTTCTGTCTCAGCTCAAGGTATCATTGACAGGATTCAAGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024558
ATGGATCCGAGAACTACAGAGGTTTCCCAACTGTTCGAGCGATTCAAAGCGGCTATTGTCCGCAAAGATTTTGATACTTGTACCCAACTTCTGTCTCAGCTCAAGGTATCATTGACAGGATTCAAGAGTCTGCCTCCATTATTTGAAGAAACTCCAAATGCCGTCTATGAATTGACACTCGCAAGGGACATTTATGAGCATGCAGTTGTCCTAAGTGTGAAGATTGAGGATCAGGATGCTTTTGAGAGAGACTTTTTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810056.1
MDPRTTEVSQLFERFKAAIVRKDFDTCTQLLSQLKVSLTGFKSLPPLFEETPNAVYELTLARDIYEHAVVLSVKIEDQDAFERDFFQLKPYYTDASGRIPPSPQEYPILGLNLLRLLVQNRIAEFHTELELLSASALENPCIKHAVELEQSFMEGAYNRVLTARQTVPHETYVYFMDLLAKTVRDEIAGCSEKAYDSLSVNDARQMLLYSSDKEVVEYIKEEHPDWEIKNGSVFFQRAKESVPCKEIPSLQLINQTLSYA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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