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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003491`

染色体: Chr05 坐标: 46421484-46423640 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003491`
名称	SmilChr05G003491
描述	uncharacterized SmilChr05G003491
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	46421484 - 46423640 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024560`
GeneID	`131024560`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024560`
原始查询	`LOC131024560`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0777700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0777700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=39; qcov=0.438; evalue=3.11e-14; confidence=low
Rice	`Os03g0777700` - identity=27.1; qcov=0.954; evalue=1.83e-14; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024560

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810058.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810058.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810058.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810058.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810058.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:46421727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr5:46421728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C28
`Chr5:46421733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:46421747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B59,B63,B75,D6
`Chr5:46421856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:46421869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr5:46421883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr5:46421884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B59,B63,D6
`Chr5:46421917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,A3,B27,C60,C69
`Chr5:46421933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr5:46421934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C52,C59,C84
`Chr5:46421993`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	161	A1,A10,A11,A14,A16,A18,A2,A21,A23,A25,A3,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B101,B104,B105,B107,B109,B110,B113,B114,B115,B119,B12,B120,B121,B124,B125,B127,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B22,B24,B27,B29,B3,B31,B32,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B46,B49,B50,B51,B54,B55,B59,B6,B60,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B73,B75,B76,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B88,B89,B90,B91,B92,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C11,C13,C14,C15,C18,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C31,C32,C35,C36,C41,C42,C43,C44,C47,C48,C51,C52,C55,C57,C58,C59,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C72,C76,C79,C8,C81,C82,C83,C85,C87,C9,D10,D11,D3,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810058.1

217 aa

108

217

SWIM

PF04434 SWIM 22-42 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810058.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	22	42	1.9e-08	34.4	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954075.1
TCTTCGTCGAAGGTCATAACCATGGACTTTCTACTCCTTCGAAGGTGCATTTGCTCTGATCTCACCGTAGTGTGTCTGTTGTGAAGAGGGTATTGACTCAACAATTTTCAGAAGCTAATATACCGACTTGTCAGCAAATGCGACTATTGGAGATAGAGTGCGGCGGCCCTGAAAGTGTAGGTTGCACAGAAAGAGATATTAGGAATTTCGAGAAAGAATTAAGGGATCAACAAAAAGAGATTGATGCTGAAACTCTGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024560
ATGAGTTTTCAAGATTGTTCGTCCTCGAAACCAAGGCTACTCGTGCATGACAAACTGAGAGACCATATATCATGCAGCTGTGGAAAATTTGAGTTTGATGGTATTCCGTGCAGACACATGTTAGCTTTCTTCCGTGTTAACCAAATATTTCATTTACCTGAAAAGTATATAGTCAAGCGATGGACACGAGATGCAAAGATTGACGCTATATATGCCATAGATGATCAAAATGCTAATGACGATCCAATAAGATTTTTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810058.1
MSFQDCSSSKPRLLVHDKLRDHISCSCGKFEFDGIPCRHMLAFFRVNQIFHLPEKYIVKRWTRDAKIDAIYAIDDQNANDDPIRFLMSRRSKLSYKASILIDDASLTDEGTKFLDEQFDYIHGKIKEMSISPTSIYESQIRKSLDKLRNISDPSEIRTKECGKRMLSSKEKSTLKARACHGCGLRGVSHDKRNCPNLHNESIADDRHGNNGKASEED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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