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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003460`

染色体: Chr05 坐标: 46007901-46009326 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003460`
名称	SmilChr05G003460
描述	DCD domain-containing protein NRP-B-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	46007901 - 46009326 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024563`
GeneID	`131024563`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024563`
原始查询	`LOC131024563`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DCD domain-containing protein NRP-B-like
产物	DCD domain-containing protein NRP-B-like
Arabidopsis	`AT3G27090` (AT3G27090) DCD (Development and Cell Death) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822327] identity=52.9; qcov=0.72; evalue=3.03e-46; confidence=medium
Rice	`Os01g0550300` (B1156H12.27-2) - identity=57.2; qcov=0.73; evalue=6.58e-51; confidence=high
GO	GO:0034976 (response to endoplasmic reticulum stress)
KEGG	-
Pfam	PF10539 (Dev_Cell_Death)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024563

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810061.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810061.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057810061.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057810061.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057810061.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:46008157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B55
`Chr5:46008249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:46008289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:46008496`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B108
`Chr5:46008496`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B108
`Chr5:46008637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B131,B46,B53
`Chr5:46009076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B68,C35,C48
`Chr5:46009134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B40,C33
`Chr5:46009201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B108,B122
`Chr5:46009201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810061.1

189 aa

189

Dev_Cell_Death

PF10539 Dev_Cell_Death 38-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810061.1`	Pfam	`PF10539`	Dev_Cell_Death	Domain	38	165	3.9e-36	124.3	Development and cell death domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954078.1
CTGAAAAATAAGTAAATATAAAATTAATTAACGGAAATCGCAACTGAACATTTGAGCGATTATAAAAGGAGGAGCTTGGGTTAGATGGTAATGGCGAGAACAAGAAAGCGATGGAGGAGACTCAGCAGAGAAAGGCGGAGGAGACTCAGAAGAGAAAGGTGAAGGCGGTGGCGCGGAAGCGGCGGGCATACTCGGAGTTCTTGCCGCTGGGTGAGGCTCTCGGCGGCTATATCTTCGTCTGCAATAATGGGACCATTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024563
ATGGAGGAGACTCAGCAGAGAAAGGCGGAGGAGACTCAGAAGAGAAAGGTGAAGGCGGTGGCGCGGAAGCGGCGGGCATACTCGGAGTTCTTGCCGCTGGGTGAGGCTCTCGGCGGCTATATCTTCGTCTGCAATAATGGGACCATTCTCGACTGTCTCCGGCGAAATATATTCGGACTCCCTGATCGTTTTGGAGAATCGGTTAGAGCAATAAGGCCTGGAACACCTGTCTTCCTCTATAATTATAGCACTAGACTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810061.1
MEETQQRKAEETQKRKVKAVARKRRAYSEFLPLGEALGGYIFVCNNGTILDCLRRNIFGLPDRFGESVRAIRPGTPVFLYNYSTRLLHGIFEAVSFGGMNIDPEAWPHPEIPGRSFYPAQVRVRCRMACPPLNRAVFRSLVGHSAANRYHQELSVSQALMLLETFQYLHWYCVTLAQQMATSAFYYWHV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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