当前解析结果
SmilChr01G002343| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002343 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002343 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002343 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 40577472 - 40582546 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024564 |
|---|---|
| GeneID | 131024564 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024564 |
| 原始查询 | LOC131024564 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os10g0563400; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os10g0563400; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT4G17540 (AT4G17540)dynamin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827469] identity=41.6; qcov=0.921; evalue=2.76e-25; confidence=medium |
| Rice | Os10g0563400- identity=40.4; qcov=0.908; evalue=6.4e-29; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024564 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.40000 | XP_057810064.1 |
| 2 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.40000 | XP_057810071.1 |
| 3 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.40000 | XP_057810064.1 |
| 4 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057810071.1 |
| 5 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057810071.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:40578884 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 22 | A1,B10,B114,B122,B132,B19,B26,B28,B30,B53,B74,B80,C22,C28,C39,C4,C46,C50,C51,C55,C60,C84 |
Chr1:40578987 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B132,B30,B53,C39,C4 |
Chr1:40579652 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B100,B61,B65 |
Chr1:40579715 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B100 |
Chr1:40579718 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B100,C71 |
Chr1:40579824 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B66,C61 |
Chr1:40579910 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。