Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003462`

染色体: Chr05 坐标: 46022780-46026992 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003462`
名称	SmilChr05G003462
描述	uncharacterized SmilChr05G003462
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	46022780 - 46026992 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024566`
GeneID	`131024566`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024566`
原始查询	`LOC131024566`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024566

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057810063.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810063.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:46026054`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B101,B102,B18,B6,B64,B93,C46
`Chr5:46026056`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A8,B10,B132,B140,B35,B48,B80,C53,C9
`Chr5:46026058`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	45	A11,A14,A18,A25,A7,B105,B108,B109,B11,B114,B120,B122,B123,B127,B131,B132,B17,B28,B29,B34,B41,B44,B52,B53,B60,B71,B73,B79,B8,B85,B91,B97,C11,C18,C24,C3,C30,C35,C37,C49,C54,C69,C77,D10,D8
`Chr5:46026068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr5:46026074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B131,B53
`Chr5:46026081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B131,B53
`Chr5:46026087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B131
`Chr5:46026097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,C76
`Chr5:46026098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B126,B20,B90,C41
`Chr5:46026102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B41,B53,C61,D2
`Chr5:46026114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B140,B48,B80,C53
`Chr5:46026150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B33,C75,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810063.1

155 aa

155

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 65-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810063.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	65	149	7.7e-14	52.7	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101906.1
TTTGTATAGCACTCACCCTTTTCTCTTGAAGACTTTATGTCATAACCTTACAACATTATTGCATGCCATTATCATTACTATTTCGAGCATATACTAAATGTGTGTACACTGTAAGAAACAGTGTCGGACACCGACGGAATCAGCGACGGAAATATGTCCGTTGTTAAATAACGACGGAATCGCCGATCGAAAACGACGGTTATAGTAGCTCCGATTCACCGTCAAATTTAACGACGGAATATTTTTACGACGGACGGATT...

XR_009101907.1
CATTATTGCATGCCATTATCATTACTATTTCGAGCATATACTAAATGTGTGTACACTGTAAGAAACAGTGTCGGACACCGACGGAATCAGCGACGGAAATATGTCCGTTGTTAAATAACGACGGAATCGCCGATCGAAAACGACGGTTATAGTAGCTCCGATTCACCGTCAAATTTAACGACGGAATATTTTTACGACGGACGGATTCCGTAGTTAAAGATGTTTTTTTATTTATTTTTTAATTTTTTTTCCAATTAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080391.1_cds_XP_057810063.1_29223
ATGGAGAAAAAATTAGGTGCCCGTGTAGGAGATGCGATAATATACGTTTCCATACTAGAAACAATGTTCAATATCACATTGCGAAGAATGAATTTGTGGGGGATTACTATATTTGGAGGTTTCATGGGGAAATTGAAATGGCCACGACTGAATATCATAACTTGGAAGAACAAGAGGCCTTCTTTTATTCACGAGGATCACTGGCCTAATTGGCTTAAGTACTGGGACTCTGATGAATTCAAAGCCAAATCAGAGATAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810063.1
MEKKLGARVGDAIIYVSILETMFNITLRRMNLWGITIFGGFMGKLKWPRLNIITWKNKRPSFIHEDHWPNWLKYWDSDEFKAKSEIAKKCRMSEPLGPGTGQVKHKGGSRSILQYAEEVAKRKGVEPTECFYDAYQILHKNKDDTYRGEHSGGLG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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