当前解析结果
SmilChr05G003463| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003463 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003463 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003463 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 46027160 - 46027797 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024568 |
|---|---|
| GeneID | 131024568 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024568 |
| 原始查询 | LOC131024568 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024568 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057810072.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810072.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810072.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057810072.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057810072.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:46027305 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B133 |
Chr5:46027310 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 10 | B102,B119,B34,B4,B52,B64,B75,C21,C57,D4 |
Chr5:46027343 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A23,B135,B4,B68,B8,C14 |
Chr5:46027363 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B134,B24,C8 |
Chr5:46027377 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B104,B133 |
Chr5:46027390 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C33,C38 |
Chr5:46027393 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 10 | B101,B102,B125,B35,B46,B64,B93,C46,C63,C69 |
Chr5:46027399 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B34,B64,B75,D4 |
Chr5:46027415 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B52,B73,C86 |
Chr5:46027434 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B125,B35,B46,B93 |
Chr5:46027460 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C3 |
Chr5:46027469 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | C72,C86 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。