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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003526`

染色体: Chr05 坐标: 47138120-47141715 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003526`
名称	SmilChr05G003526
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47138120 - 47141715 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024598`
GeneID	`131024598`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024598`
原始查询	`LOC131024598`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=33.9; qcov=0.673; evalue=2.63e-46; confidence=low
Rice	`Os01g0852650` - identity=34.9; qcov=0.717; evalue=1.44e-61; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024598

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810090.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810090.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810090.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810090.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810090.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47138613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:47138764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B41,B46,B53
`Chr5:47138773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:47138782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B119
`Chr5:47138782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr5:47138796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr5:47138797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:47138808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B41,B46,B53
`Chr5:47138811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:47138827`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	86	A1,A18,A20,A23,A4,A5,A6,B1,B100,B101,B104,B107,B11,B110,B113,B115,B12,B121,B126,B13,B131,B134,B135,B137,B14,B17,B18,B2,B27,B30,B32,B35,B37,B4,B40,B48,B5,B57,B59,B6,B67,B72,B74,B76,B79,B88,B89,B90,B92,B99,C14,C15,C16,C19,C20,C21,C24,C31,C32,C35,C36,C39,C42,C44,C47,C48,C55,C56,C58,C6,C61,C62,C63,C67,C68,C7,C70,C73,C77,C79,C8,C80,C82,C87,D11,D6
`Chr5:47138850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B69,B9
`Chr5:47138859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810090.1

452 aa

226

452

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 133-220 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 319-426 aa PF10551 MULE 343-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810090.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	133	220	1.7e-18	67.9	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057810090.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	319	426	1.3e-06	29.0	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057810090.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	343	437	4.3e-21	75.8	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101946.1
GCTCGGTGCCCGAGGAAAAAAATTGCAGAGAGTTCCGCCCGAAGAAGAAACCGATCGGTGCCCAAAATTTGTTGAGAGGGTTTGGCCAAGAGTAACATTTTTCAACGGAAAATTTAACTCCGAATCCGAAAATGTCTTCAGATTCAAGAACGATGGCGTATACAAAAGTGCCTGCAATTTTTGGTGAAGCTTGAATGTTCATCAAGGAGTTTCAAACTTTACAAAATTTAATTTAAATATTACAAAGATTTTGCATTCAT...

XM_057954107.1
GCTCGGTGCCCGAGGAAAAAAATTGCAGAGAGTTCCGCCCGAAGAAGAAACCGATCGGTGCCCAAAATTTGTTGAGAGGGTTTGGCCAAGAGTAACATTTTTCAACGGAAAATTTAACTCCGAATCCGAAAATGTCTTCAGATTCAAGAACGATGGCGTATACAAAAGTGCCTGCAATTTTTGGTGAAGCTTGAATGTTCATCAAGGAGTTTCAAACTTTACAAAATTTAATTTAAATATTACAAAGATTTTGCATTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024598
ATGGCCGAGGAGCAAAAGAAGTTGTCTAGGGAAAGCATTGATTTGAATCAAGTACTGGGTTTCGAAGATAGTGACGACGAGGTCCCAAGCGTACAAAAAAATGATCCAAAAGATCCGTCTGATGCGGCTAAAGAAAATGTAGAGTTTCACTCTGATGTACATGAATGTGACGAGAATGGGGATATGGGAAATTTTTTTGATAAGCATGGTGAAGATGGTGTTTCTGGTGAAAAGGATGAACGTGCTGGTAAAGAGAATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810090.1
MAEEQKKLSRESIDLNQVLGFEDSDDEVPSVQKNDPKDPSDAAKENVEFHSDVHECDENGDMGNFFDKHGEDGVSGEKDERAGKENMENLGNKNGNWFCSDEAHDNLSVPEWEEMLAVGSTLGKNLVHIYGDYLQYSHKKGFSVRRGYQKRLGARGEIRLKQFVCSSSGLTDCKRQKISLGVYKKMVTRTDCEAKLVVSRKDEGPFVVSIFETVHNHELMATDMSYMLRSNRNLNIGHQSVLQAMKEASIGISVACKFME...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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