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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003529`

染色体: Chr05 坐标: 47157888-47164005 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003529`
名称	SmilChr05G003529
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 homolog B
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47157888 - 47164005 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024602`
GeneID	`131024602`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024602`
原始查询	`LOC131024602`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 homolog B
产物	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 homolog B
Arabidopsis	`AT5G45620` (AT5G45620) Proteasome component (PCI) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834602] identity=83.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0214600` (OsRpn9b) - identity=79.4; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0008541 (proteasome regulatory particle, lid subcomplex)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01399 (PCI); PF22037 (PSD13_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024602

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810093.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057810093.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810093.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057810093.1`
5	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057810093.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47158328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B138,B60,B91,C25
`Chr5:47158924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C82,D6
`Chr5:47161235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B41,B46,B53
`Chr5:47163784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810093.1

386 aa

193

386

PSD13_N

PCI

PF22037 PSD13_N 21-242 aa PF01399 PCI 264-344 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810093.1`	Pfam	`PF22037`	PSD13_N	Repeat	21	242	3.1e-74	250.5	PSD13 N-terminal repeats
`XP_057810093.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	264	344	1e-10	42.4	PCI domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954110.1
GTTTCTTTGGGAAAAAGAAAAGAGAGGAAAATAAATCAAAATTAAGGAACATTTAAATTTCCATATACACTCTACATATAAATCTCCTCCTCCTTCATTTTCTCCTTCTCTCTCTAGAGTTTGATACCGGCGAAGCACCACTGTTTCGCGTAGATTGGACGGCGTAACGAATCGATGGCGGCTCTACAGTATCTGGAATCCCTGCGTAATGCGCACCCGGAGCTGACCGAGTGGTACAACACGCTTTCAGATCTGTACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024602
ATGGCGGCTCTACAGTATCTGGAATCCCTGCGTAATGCGCACCCGGAGCTGACCGAGTGGTACAACACGCTTTCAGATCTGTACCAGAGGAAGCTCTGGCACCAGCTCACGCTCAAGCTCGAGCAATTCGTCACGCTCGCCGTGTTTCAGGCTGGGGATTCCCTAATTCAACTGTACCAAAACTTTATAACTGATTTTGAGACAAAGATCAATCTACTCAAGCTTGCCCATTTTGCTGTCATAGTTTCTCGGCAGTATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810093.1
MAALQYLESLRNAHPELTEWYNTLSDLYQRKLWHQLTLKLEQFVTLAVFQAGDSLIQLYQNFITDFETKINLLKLAHFAVIVSRQYSEKDAAISYLEGVIEKLRNTSKVRIEEPILYINMQIGLLKLEQGDQKECKKLLEEGKSTLDSMTDIDPSVYASYYWISSQYHKARQEFAEFYRSALLYLAYTSVETLSESFKLDLAFDLSLSALLGENIYNFGELLAHPIIKSLMGTKVEWLYYILEAFNSGDLVRYQELCRVH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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