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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003252`

染色体: Chr05 坐标: 41914380-41916708 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003252`
名称	SmilChr05G003252
描述	uncharacterized protein At1g26090, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	41914380 - 41916708 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024614`
GeneID	`131024614`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024614`
原始查询	`LOC131024614`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839150]; symbol=AT1G26090; hit=AT1G26090; species=arabidopsis; confidence=high
产物	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839150]; symbol=AT1G26090; hit=AT1G26090; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G26090` (AT1G26090) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839150] identity=54.2; qcov=0.948; evalue=1.67e-134; confidence=high
Rice	`Os02g0711200` - identity=63.1; qcov=0.437; evalue=4.21e-66; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02374 (ArsA_ATPase); PF17886 (ArsA_HSP20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024614

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810108.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057810109.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057810108.1`
4	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057810108.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810109.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:41914780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D6
`Chr5:41914911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B45
`Chr5:41915306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C35
`Chr5:41915342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr5:41915528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810108.1

456 aa

228

456

ArsA_ATPase

ArsA_HSP20

PF02374 ArsA_ATPase 61-303 aa PF17886 ArsA_HSP20 396-455 aa

XP_057810109.1

403 aa

202

403

ArsA_ATPase

PF02374 ArsA_ATPase 61-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810108.1`	Pfam	`PF02374`	ArsA_ATPase	Domain	61	303	4.1e-18	66.3	Anion-transporting ATPase
`XP_057810108.1`	Pfam	`PF17886`	ArsA_HSP20	Domain	396	455	4.7e-12	46.0	HSP20-like domain found in ArsA
`XP_057810109.1`	Pfam	`PF02374`	ArsA_ATPase	Domain	61	303	3.6e-18	66.5	Anion-transporting ATPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954125.1
AAGTGAGGCCATTTTTTTGGCAGAAAATATGAAAATGAAATTGGTGCAGATTTTGTGACAATACAAAGAGTTTGGTGCAATTCTTTAAAGAAAACGCATTTTGATGGCCTAATTTCTAAACTAAATTTCTTCCCCCATTCTCTACTCTCACCTTTAAAATCTTCGCCAATTACTACATTCCGATTCAGCAGAAGAAGAATCAATCAATGGCGTCCTGCCCTTCGCTCATTCTTCCGCGCTCACTCTTCCCGCCTCAAGAT...

XM_057954126.1
AGAAAATATGAAAATGAAATTGGTGCAGATTTTGTGACAATACAAAGAGTTTGGTGCAATTCTTTAAAGAAAACGCATTTTGATGGCCTAATTTCTAAACTAAATTTCTTCCCCCATTCTCTACTCTCACCTTTAAAATCTTCGCCAATTACTACATTCCGATTCAGCAGAAGAAGAATCAATCAATGGCGTCCTGCCCTTCGCTCATTCTTCCGCGCTCACTCTTCCCGCCTCAAGATTTTCGCTGTTTTTCTCCGGTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024614
ATGGCGTCCTGCCCTTCGCTCATTCTTCCGCGCTCACTCTTCCCGCCTCAAGATTTTCGCTGTTTTTCTCCGGTCAAAACACCTTGGATAAGAAGAGGAAGTAGAAGAGCCGAAAGAGGTGACCCCATAATTATGACTGTCGCCGCCGCCAATGCTGATGCCGGCGATGTTAAACCGGCCAAGTTGGTTACTTTCCTGGGTAAAGGCGGTTCCGGTAAAACTACCGCCGCCGTTTTTGCAGCTCTGCATTATGCTACATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810108.1
MASCPSLILPRSLFPPQDFRCFSPVKTPWIRRGSRRAERGDPIIMTVAAANADAGDVKPAKLVTFLGKGGSGKTTAAVFAALHYATLGLKTCLVIQSQDPTAEYLLNCKIGSSSPVQCNENLSAVRLETTKMILEPLKKLKQADAQLNMTQGILEGVVGEELGVLPGMDSIFSSLELERLVGFFVSQRKGGKAKYDIVVYDGINTEETIRMIGATSKARLYLKYLRMLAEKTDFGRVAAPSLLRLVDDALSLSGNAVKLT...

XP_057810109.1
MASCPSLILPRSLFPPQDFRCFSPVKTPWIRRGSRRAERGDPIIMTVAAANADAGDVKPAKLVTFLGKGGSGKTTAAVFAALHYATLGLKTCLVIQSQDPTAEYLLNCKIGSSSPVQCNENLSAVRLETTKMILEPLKKLKQADAQLNMTQGILEGVVGEELGVLPGMDSIFSSLELERLVGFFVSQRKGGKAKYDIVVYDGINTEETIRMIGATSKARLYLKYLRMLAEKTDFGRVAAPSLLRLVDDALSLSGNAVKLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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