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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003262`

染色体: Chr05 坐标: 42186576-42187141 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003262`
名称	SmilChr05G003262
描述	glycine-rich RNA-binding protein RZ1C-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	42186576 - 42187141 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024623`
GeneID	`131024623`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024623`
原始查询	`LOC131024623`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycine-rich RNA-binding protein RZ1C-like
产物	glycine-rich RNA-binding protein RZ1C-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024623

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057810111.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810111.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057810111.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810111.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810111.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:42186673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr5:42186677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C80
`Chr5:42186797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr5:42186820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr5:42186825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B52,B74,C16,C26,C9
`Chr5:42186825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B52,B74,C16,C26,C9
`Chr5:42186842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B74,C16,C26,C9
`Chr5:42186842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,C16,C26,C9
`Chr5:42186853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B53,C28,C44
`Chr5:42186859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B110,B17,B66,C50
`Chr5:42186871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,C8
`Chr5:42186878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810111.1

123 aa

123

zf-CCHC

PF00098 zf-CCHC 93-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810111.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	93	109	1.1e-07	32.3	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954128.1
TAGACATGGTTCTCTACACTCTGCCCAAATCCTACGAAAACTTCCGACTCAATGCCGTAATGGGCAAGAAAAAGTTCACTCTAAATGAACTGCTTAATGAGTTGGTTGCGGCCGAGGGGGTCATGGGAAAGAGTCCACAGGCTTTGGCCACTGCCACAGGACCCAGTTTTCCACCGAAAGGTAGGAAGAAGAAAGGGCCCCATGGCAAGAAAGGCCAAGCAAAAGGTGGGAGCAAGAAGAAGCTAGGCCCGACCGGAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024623
ATGGTTCTCTACACTCTGCCCAAATCCTACGAAAACTTCCGACTCAATGCCGTAATGGGCAAGAAAAAGTTCACTCTAAATGAACTGCTTAATGAGTTGGTTGCGGCCGAGGGGGTCATGGGAAAGAGTCCACAGGCTTTGGCCACTGCCACAGGACCCAGTTTTCCACCGAAAGGTAGGAAGAAGAAAGGGCCCCATGGCAAGAAAGGCCAAGCAAAAGGTGGGAGCAAGAAGAAGCTAGGCCCGACCGGAGGCGTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810111.1
MVLYTLPKSYENFRLNAVMGKKKFTLNELLNELVAAEGVMGKSPQALATATGPSFPPKGRKKKGPHGKKGQAKGGSKKKLGPTGGVGKPKGKGKCFKCQQVGHWKSDCPMMKKAQGVPADKGA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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