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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003286`

染色体: Chr05 坐标: 42954024-42958204 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003286`
名称	SmilChr05G003286
描述	methionine aminopeptidase 1B, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	42954024 - 42958204 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024641`
GeneID	`131024641`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024641`
原始查询	`LOC131024641`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methionine aminopeptidase 1B, chloroplastic
产物	methionine aminopeptidase 1B%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G13270` (MAP1C) methionine aminopeptidase 1B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837887] identity=71; qcov=0.914; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0610500` - identity=68.7; qcov=0.847; evalue=7.71e-163; confidence=high
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0070006 (metalloaminopeptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00557 (Peptidase_M24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024641

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810128.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057810128.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057810128.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810128.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810128.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:42954552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:42954565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr5:42954570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C15,C52,C84
`Chr5:42954584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:42954586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:42954903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B84
`Chr5:42955388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B24,C4,C67
`Chr5:42956122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B69,B9
`Chr5:42957341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C15,C52,C84
`Chr5:42957612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B30,B31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810128.1

373 aa

186

373

Peptidase_M24

PF00557 Peptidase_M24 127-353 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810128.1`	Pfam	`PF00557`	Peptidase_M24	Domain	127	353	2.1e-50	172.1	Metallopeptidase family M24

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954145.1
AGTAAAATTTGAGCACGATAAGGCAAGCCTAAAGCGGAGCAATATGTAAGCACATATTTTAGGGATAATAATTGTAAATAAACAAATACTTTTGTCATATTTTAAATTGCCTTCTGAAATGATTCAATAATATCACTACCTTTTGATCCGTACCTATTTAATAGCCTGACTTATCCAGCATTAAAGTGAATTTGTTTCGGCCACAAATTTTGGTTGGAAAAATTAGAAATAATTGGGATTCGAAGCCCAATGGACTCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024641
ATGATAGCGGGAGATATTTCTGTCTCATCTCCTTCCCCTTTCAGCTTCTATGGCCAAGCAAGACTGTCAGCATCGTCCTCTCTTCTCATGGGGGGCCCACTCAGCGCTTCGCCTCCCTACACCCACAGTGCAAAGTTGATGAGACGGCTTGTTGTTTATTCGAAGAGAATATCAGGCTTGGAGGAGGCCATCAGAATAAGAAGAGAGCGTGAGCTTCGAACTTCAACTACGTCCAAAAGACGGCCTCCTTTGAGGCGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810128.1
MIAGDISVSSPSPFSFYGQARLSASSSLLMGGPLSASPPYTHSAKLMRRLVVYSKRISGLEEAIRIRRERELRTSTTSKRRPPLRRGRVSPGFPVPDHIPRPPYVGTKLLPDIAKEHQVHDSEGLARMRAACELAARVVDYGGTLVRPSITTNEIDKAVHQMIIDAGAYPSPLGYGGFPKSVCTSVNECMCHGIPDSRQLQDGDIINIDVTVYLNGYHGDTSKTFLCGNVSNAMQRLVKVTEECMYKGIDACQDGALFRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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