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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002351`

染色体: Chr01 坐标: 40644255-40649496 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002351`
名称	SmilChr01G002351
描述	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit-related protein 4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40644255 - 40649496 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024645`
GeneID	`131024645`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024645`
原始查询	`LOC131024645`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit-related protein 4, chloroplastic
产物	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit-related protein 4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G17040` (CLPR4) CLP protease R subunit 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827412] identity=82.2; qcov=0.875; evalue=2.06e-158; confidence=high
Rice	`Os01g0271400` (OsClpR4) - identity=81.5; qcov=0.753; evalue=2.91e-123; confidence=high
GO	GO:0004176 (ATP-dependent peptidase activity); GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006515 (protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins); GO:0009368 (endopeptidase Clp complex); GO:0051117 (ATPase binding)
KEGG	-
Pfam	PF00574 (CLP_protease)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024645

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810135.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057810135.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810135.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810135.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810135.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40644710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,D3
`Chr1:40644884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,D3
`Chr1:40644893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D11
`Chr1:40644923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B103,C31,C9
`Chr1:40646011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:40646958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,C11,C69
`Chr1:40649189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:40649233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:40649317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr1:40649372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810135.1

295 aa

148

295

CLP_protease

PF00574 CLP_protease 95-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810135.1`	Pfam	`PF00574`	CLP_protease	Domain	95	275	1.4e-51	175.7	Clp protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954152.1
ATGGCTGGGATTACCCAACCTTAATATGCACTGCTACTTCATTTTCGCTGAAACTGAAATTATAAATTTATAATCATAAACCTCTCTCTCTCTGTCTACCTAGTGCTGCTATGGCTTCGCTCCTGTTTCCGACTACCCGCATGAGACTAAACACCAGCCTAAGTGCAGCCGCGCCTCCTCCTCCTTCACCGTCTTCCCGGAGGCCATCTCCGCCGACGAGTTTTCTCTCTCCTTTCGTTGGTGGCAGCATCTCCGGCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024645
ATGGCTTCGCTCCTGTTTCCGACTACCCGCATGAGACTAAACACCAGCCTAAGTGCAGCCGCGCCTCCTCCTCCTTCACCGTCTTCCCGGAGGCCATCTCCGCCGACGAGTTTTCTCTCTCCTTTCGTTGGTGGCAGCATCTCCGGCGACTTTGCGGGTCTGAGGATCCGACCCGCTTCCCTTGTTAACACCTCCTCCAATTCGACCTCTCGAGGGAAACGCGGCGTTGTTACTATGGTAATCCCTTTCTCCAGAGGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810135.1
MASLLFPTTRMRLNTSLSAAAPPPPSPSSRRPSPPTSFLSPFVGGSISGDFAGLRIRPASLVNTSSNSTSRGKRGVVTMVIPFSRGSAWEQPPPDLASYLYKNRIVYLGMSLVPSVTELILAEFLYLQYEDEEKPIYLYVNSTGTTKGGEKLGYETEAFAIYDVMRYVKPPIFTLCVGNAWGEAALLLAAGAKGNRSALPSSTIMIKQPIARFQGQATDVELMRKEVRNVKAELVKLYAKHIGKSPEEIEEDIRRPKYFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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