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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003292`

染色体: Chr05 坐标: 43046187-43049420 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003292`
名称	SmilChr05G003292
描述	uncharacterized SmilChr05G003292
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	43046187 - 43049420 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024646`
GeneID	`131024646`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024646`
原始查询	`LOC131024646`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837891]; symbol=AT1G13310; hit=AT1G13310; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837891]; symbol=AT1G13310; hit=AT1G13310; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G13310` (AT1G13310) Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837891] identity=40.7; qcov=1.01; evalue=4.97e-69; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03097 (BRO1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024646

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810132.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057810132.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057810132.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810132.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810132.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:43046635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr5:43046848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr5:43047213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:43047834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr5:43047840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C15,C52,C84
`Chr5:43048274`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B101,B55
`Chr5:43048274`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B101,B55
`Chr5:43048409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810132.1

379 aa

190

379

BRO1

PF03097 BRO1 69-366 aa

XP_057810133.1

379 aa

190

379

BRO1

PF03097 BRO1 69-366 aa

XP_057810134.1

319 aa

160

319

BRO1

PF03097 BRO1 10-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810132.1`	Pfam	`PF03097`	BRO1	Repeat	69	366	1.3e-23	84.2	BRO1-like domain
`XP_057810133.1`	Pfam	`PF03097`	BRO1	Repeat	69	366	1.3e-23	84.2	BRO1-like domain
`XP_057810134.1`	Pfam	`PF03097`	BRO1	Repeat	10	306	1.4e-23	84.2	BRO1-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954150.1
AGAAGGTGTGATGTGCGTAGATGGGCCAGAAGACTAAGCCCAAGAAGCGCGGGAGACGATCCGGGTCAACTCGGAACCAACGCGACCCTATAAATATCTAAACTCAATACTCTTAGCTGAGAAGGAAAACAAGTGTTTTGAGTCGAAAGCGACCCAGCAGACTACATATAATCAATGAAGTATACGCGCTCTAATTTTCAGTGAAAAACTGAGTCTTGATCGTCCGAGGAGTCAGCTTTGTTGCTAATGCTAATTTAGTC...

XM_057954149.1
GGAAAACAAGTGTTTTGAGTCGAAAGCGACCCAGCAGACTACATATAATCAATGAAGTATACGCGCTCTAATTTTCAGGTATCTGCGCTGCACACCACATATTTATTTAACAAAATTTGCCAATTAATTTCTAGGTTTCCTGTAAAACTTCCGCTTCATTTGCAGTGTCTCAATTTTCAATTATTTTGCTGTAAACCCATTATTGGTGATGATCTTAAACCCCTCGTATTTGGAGTGGGTTGATCGACCCTTTTGAGTCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131024646
ATGATGATCAGTTATCCAGCCCTTTCGAAGCTGAAAACTAAGCCGGTAGTATACGAAGATGTGATTGCGGCTAGCGATTCTGGCACACTCGAACAACTGAAAGAGTTGAGCTCCAAGCGTAAAGCAATTGAGGACTCTATCAATGAGAGCACCTTCATTACAGAGGCCATTGCAAGGGAAATGTCTGGAGGCCTCACATCCCGTTGTGAACAGGACATTCAGAAGCTGGAAAGCTATCTACCTCTGTTGGAGAACCTCAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057810132.1
MMISYPALSKLKTKPVVYEDVIAASDSGTLEQLKELSSKRKAIEDSINESTFITEAIAREMSGGLTSRCEQDIQKLESYLPLLENLIHHIIFNARNRQVMYWITEFKLRWSSVLSMPSLFQLQGPKFYQVNDMYFELGMSVFLYGSLLREQAFEVLSSDLVQSATIFRKAAGIYNYAAQELRTNLSWTQEKPPEAIPSVSSVMSLVCLADAQAVSARKALENGNTGGLLAKLHCGVTDFLVEAINILQGATKECKDISPR...

XP_057810133.1
MMISYPALSKLKTKPVVYEDVIAASDSGTLEQLKELSSKRKAIEDSINESTFITEAIAREMSGGLTSRCEQDIQKLESYLPLLENLIHHIIFNARNRQVMYWITEFKLRWSSVLSMPSLFQLQGPKFYQVNDMYFELGMSVFLYGSLLREQAFEVLSSDLVQSATIFRKAAGIYNYAAQELRTNLSWTQEKPPEAIPSVSSVMSLVCLADAQAVSARKALENGNTGGLLAKLHCGVTDFLVEAINILQGATKECKDISPR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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